RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476342.1

HOXB3-208, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,420 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-208ENST00000476342 FAM205AQ6ZU69 1335 aa36.34■■■■□ 3.41
HOXB3-208ENST00000476342 LRRCC1Q9C099 1032 aa36.34■■■■□ 3.41
HOXB3-208ENST00000476342 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
HOXB3-208ENST00000476342 SEMA3EO15041 775 aa36.32■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 KIF3CO14782 793 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 AACSQ86V21 672 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 DBNDD2Q9BQY9 259 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 JAG2Q9Y219 1238 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 H7C1D1 291 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 ZBTB22O15209 634 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 EPHX2P34913 555 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 EPS15P42566 896 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 CCDC158Q5M9N0 1113 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 MICALL2Q8IY33 904 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 MXD3Q9BW11 206 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 DENND2AQ9ULE3 1009 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa36.29■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 GMLQ99445 158 aa36.29■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 MFSD14BQ5SR56 506 aa36.28■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 GCC1Q96CN9 775 aa36.28■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa36.26■■■■□ 3.4
HOXB3-208ENST00000476342 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 USP17L8P0C7I0 530 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 MMP14P50281 582 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 TTC39AQ5SRH9 613 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 OGFOD1Q8N543 542 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 WDR66Q8TBY9 1149 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 CERS5Q8N5B7 392 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 BCL11AQ9H165 835 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 NEFLP07196 543 aa36.24■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 RASGRF1Q13972 1273 aa36.24■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 KIAA0825Q8IV33 1275 aa36.24■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 HDAC9Q9UKV0 1011 aa36.24■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 SHTN1A0MZ66 631 aa36.22■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
HOXB3-208ENST00000476342 TOMM70O94826 608 aa36.19■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa36.19■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 SALL1Q9NSC2 1324 aa36.19■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 SAMD7Q7Z3H4 446 aa36.18■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 SPATA5Q8NB90 893 aa36.18■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 F8W031 263 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 MCAMP43121 646 aa36.17■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 MYOZ2Q9NPC6 264 aa36.17■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 HMG20BQ9P0W2 317 aa36.17■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 IGHDP01880 384 aa36.17■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa36.17■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 LDHDQ86WU2 507 aa36.17■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 TRPM4Q8TD43 1214 aa36.17■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa36.16■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 SMC5Q8IY18 1101 aa36.16■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 AKAP11Q9UKA4 1901 aa36.16■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 ANKRD45Q5TZF3 282 aa36.15■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 CLEC11AQ9Y240 323 aa36.15■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 MAST3O60307 1309 aa36.14■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 SCARF1Q14162 830 aa36.14■■■■□ 3.38
HOXB3-208ENST00000476342 POTEIP0CG38 1075 aa36.13■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 POTEJP0CG39 1038 aa36.13■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 PI16Q6UXB8 463 aa36.13■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 EGFRP00533 1210 aa36.12■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 LDHBP07195 334 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 ABCF2Q9UG63 623 aa36.11■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 GRIK5Q16478 980 aa36.1■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 SMC1BQ8NDV3 1235 aa36.1■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 GPATCH3Q96I76 525 aa36.1■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 PRDX5P30044 214 aa36.09■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 CHADLQ6NUI6 762 aa36.09■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP36.09■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 SNRKQ9NRH2 765 aa36.09■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 SERPINA10Q9UK55 444 aa36.09■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 DLGAP5Q15398 846 aa36.08■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 MTMR14Q8NCE2 650 aa36.08■■■■□ 3.37
HOXB3-208ENST00000476342 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP36.07■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms