RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.56■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 TRPM4Q8TD43 1214 aa16.56■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa16.56■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 AKAP2Q9Y2D5 859 aa16.56■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 ZBTB22O15209 634 aa16.55■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 CAPN15O75808 1086 aa16.55■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 FGFR2P21802 821 aa16.55■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 SIL1Q9H173 461 aa16.55■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.55■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 TNNQ9UQP3 1299 aa16.55■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 GYG1P46976 350 aa16.54■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 PDE3AQ14432 1141 aa16.54■□□□□ 0.24
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PRAME-211ENST00000476336 CST9Q5W186 159 aa16.54■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 SULF1Q8IWU6 871 aa16.54■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 SHTN1A0MZ66 631 aa16.53■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 RLBP1P12271 317 aa16.53■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 ATP8B2P98198 1209 aa16.53■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.244e-26■□□□□ 9.3
PRAME-211ENST00000476336 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 ATP2B3Q16720 1220 aa16.53■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 KRT26Q7Z3Y9 468 aa16.53■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa16.53■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 ARAP2Q8WZ64 1704 aa16.53■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 MYH13Q9UKX3 1938 aa16.53■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 SEMA3EO15041 775 aa16.52■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 MYO1BO43795 1136 aa16.52■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 ECE1P42892 770 aa16.52■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 SCARF1Q14162 830 aa16.52■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 MVPQ14764 893 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 MFSD14BQ5SR56 506 aa16.52■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 KIAA0825Q8IV33 1275 aa16.52■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 MTMR14Q8NCE2 650 aa16.52■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 SSH3Q8TE77 659 aa16.52■□□□□ 0.24
PRAME-211ENST00000476336 TRAF5O00463 557 aa16.51■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 EGFRP00533 1210 aa16.51■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 POLA2Q14181 598 aa16.51■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 PANK1Q8TE04 598 aa16.51■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 GGA3Q9NZ52 723 aa16.51■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 TLL2Q9Y6L7 1015 aa16.51■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 MAST3O60307 1309 aa16.5■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 ECM29Q5VYK3 1845 aa16.5■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa16.5■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 WNT10BO00744 389 aa16.5■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 BCAMP50895 628 aa16.5■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 DLGAP5Q15398 846 aa16.5■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 WDR66Q8TBY9 1149 aa16.5■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 HHIPL1Q96JK4 782 aa16.5■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 CAPNS2Q96L46 248 aa16.5■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 MRIQ9BWK5 157 aa16.5■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 LBX1P52954 281 aa16.49■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 USP48Q86UV5 1035 aa16.49■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 CERS5Q8N5B7 392 aa16.49■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 MXD3Q9BW11 206 aa16.49■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.49■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 HMMRO75330 724 aa16.48■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 CELF2O95319 508 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa16.48■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 GPR108Q9NPR9 543 aa16.48■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 DENND2AQ9ULE3 1009 aa16.48■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 THSD7BQ9C0I4 1608 aa16.48■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 MAP2K2P36507 400 aa16.47■□□□□ 0.23
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PRAME-211ENST00000476336 TFCP2Q12800 502 aa16.47■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 NBPF9Q3BBW0 867 aa16.47■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 CYP4F22Q6NT55 531 aa16.47■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 SAPCD2Q86UD0 394 aa16.47■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 ERC1Q8IUD2 1116 aa16.47■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 COG6Q9Y2V7 657 aa16.47■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 A0A1B0GUL7 405 aa16.46■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 SURF6O75683 361 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 NF2P35240 595 aa16.46■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 CEP85Q6P2H3 762 aa16.46■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 C2orf69Q8N8R5 385 aa16.46■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 BEGAINQ9BUH8 593 aa16.46■□□□□ 0.23
PRAME-211ENST00000476336 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.46■□□□□ 0.23
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