RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 SCARF1Q14162 830 aa24.71■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 KLRG1Q96E93 195 aa24.71■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.71■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 BCAMP50895 628 aa24.7■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 ATP2B3Q16720 1220 aa24.7■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 GGA3Q9NZ52 723 aa24.7■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.69■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 ATP8B2P98198 1209 aa24.69■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.69■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 USP48Q86UV5 1035 aa24.69■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 PCNTO95613 3336 aa24.68■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.67■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 SULF1Q8IWU6 871 aa24.67■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 F8W031 263 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 WNT10BO00744 389 aa24.66■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 POLA2Q14181 598 aa24.66■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.66■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 CST9Q5W186 159 aa24.66■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 SSH3Q8TE77 659 aa24.66■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.66■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 COG6Q9Y2V7 657 aa24.66■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.65■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 CELF2O95319 508 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 TFCP2Q12800 502 aa24.65■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.65■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 ADM5C9JUS6 153 aa24.64■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.64■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF408Q9H9D4 720 aa24.64■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
CTPS1-206ENST00000470271 PDE3AQ14432 1141 aa24.63■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 DLGAP5Q15398 846 aa24.63■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 DLK2Q6UY11 383 aa24.63■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 CNTNAP1P78357 1384 aa24.63■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 TIMM10P62072 90 aa24.62■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 CEP85Q6P2H3 762 aa24.62■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.62■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.61■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 A0A1B0GUL7 405 aa24.61■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 ADORA1P30542 326 aa24.61■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 CFAP100Q494V2 611 aa24.61■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 RASSF10A6NK89 507 aa24.6■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 PHKA1P46020 1223 aa24.6■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 DEFB115Q30KQ5 88 aa24.6■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.6■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 JMYQ8N9B5 988 aa24.6■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.6■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.6■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 XAGE2Q96GT9 111 aa24.59■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.59■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 TLL2Q9Y6L7 1015 aa24.59■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.58■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 SEMA3EO15041 775 aa24.58■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 SPDYE6P0CI01 402 aa24.58■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 GRIK5Q16478 980 aa24.58■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC102BQ68D86 513 aa24.58■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.58■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 CDCA5Q96FF9 252 aa24.58■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.58■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.58■■□□□ 1.53
CTPS1-206ENST00000470271 MYO1BO43795 1136 aa24.57■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 SAPCD2Q86UD0 394 aa24.57■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.57■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.57■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 ZBTB22O15209 634 aa24.56■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 CRKP46108 304 aa24.55■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 VEGFBP49765 207 aa24.55■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.54■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 GORABQ5T7V8 394 aa24.54■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.54■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 GPR108Q9NPR9 543 aa24.54■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 MAST3O60307 1309 aa24.54■■□□□ 1.52
CTPS1-206ENST00000470271 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
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