RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 CAPNS2Q96L46 248 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 WNT10BO00744 389 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 CIAO1O76071 339 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 DLK2Q6UY11 383 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDCA5Q96FF9 252 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 VPS37DQ86XT2 251 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 FGFR2P21802 821 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNNQ9UQP3 1299 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 MTX1Q13505 466 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 JAG2Q9Y219 1238 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 HUNKP57058 714 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 SIL1Q9H173 461 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 COPRSQ9NQ92 184 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC5A1P13866 664 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 DLGAP5Q15398 846 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 LPIN2Q92539 896 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 AIDAQ96BJ3 306 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 WBP1LQ9NX94 342 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 F8W031 263 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 FKBP1BP68106 108 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 GRM1Q13255 1194 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 SRGAP3O43295 1099 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 GNAI2P04899 355 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAP2K2P36507 400 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPDYE6P0CI01 402 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 BCAMP50895 628 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 CFAP100Q494V2 611 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 FOXN1O15353 648 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYO1BO43795 1136 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATP2B3Q16720 1220 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 NOGQ13253 232 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 RGMBQ6NW40 437 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 AOC2O75106 756 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 NF2P35240 595 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC102AQ96A19 550 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAST3O60307 1309 aa23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZBTB22O15209 634 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 RLBP1P12271 317 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 AOX1Q06278 1338 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 CLRN2A0PK11 232 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC10A3P09131 477 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 CRKP46108 304 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 SEMA3EO15041 775 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC10-208ENST00000469521 GRIK5Q16478 980 aa23.37■■□□□ 1.33
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