RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	GPC2	Q8N158	579 aa		10.2	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	SPATA5	Q8NB90	893 aa		10.2	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		10.2	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		10.2	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		10.2	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		10.2	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710		H7C1D1	291 aa		10.19	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	ERC2	O15083	957 aa		10.19	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	ZAP70	P43403	619 aa		10.19	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	RASGRF1	Q13972	1273 aa		10.19	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	SCARF1	Q14162	830 aa		10.19	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		10.19	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	DACT2	Q5SW24	774 aa		10.19	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		10.19	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		10.19	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	OGFOD1	Q8N543	542 aa		10.19	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		10.19	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		10.19	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		10.19	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	ZNF609	O15014	1411 aa		10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	USP17L8	P0C7I0	530 aa		10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	ATP5J	P18859	108 aa		10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	MX1	P20591	662 aa		10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	MCAM	P43121	646 aa		10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	PI16	Q6UXB8	463 aa		10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	RAI14	Q9P0K7	980 aa		10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		10.18	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		10.17	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		10.17	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	EPS15	P42566	896 aa		10.17	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	SCNN1D	P51172	638 aa		10.17	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	MICALL2	Q8IY33	904 aa		10.17	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	DPF2	Q92785	391 aa		10.17	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	HACL1	Q9UJ83	578 aa		10.17	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		10.17	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	COL4A5	P29400	1685 aa		10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	GOLIM4	O00461	696 aa		10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	RGS3	P49796	1198 aa		10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	PDE1A	P54750	535 aa		10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	CERS5	Q8N5B7	392 aa		10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	RILPL2	Q969X0	211 aa		10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		10.16	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	SBF1	O95248	1867 aa		10.15	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	SHTN1	A0MZ66	631 aa		10.15	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	PDE4A	P27815	886 aa		10.15	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	EPHX2	P34913	555 aa		10.15	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	DLGAP5	Q15398	846 aa		10.15	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	GRIK5	Q16478	980 aa		10.15	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		10.15	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	HAUS7	Q99871	368 aa		10.15	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		10.15	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		10.15	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	STAP2	Q9UGK3	403 aa		10.15	□□□□□ -0.78
IL6-208	ENST00000464710	LTBP1	Q14766	1721 aa		10.14	□□□□□ -0.79
IL6-208	ENST00000464710	CHD4	Q14839	1912 aa		10.14	□□□□□ -0.79
IL6-208	ENST00000464710	LDHC	P07864	332 aa		10.14	□□□□□ -0.79
IL6-208	ENST00000464710	PRDX5	P30044	214 aa		10.14	□□□□□ -0.79
IL6-208	ENST00000464710	CRK	P46108	304 aa		10.14	□□□□□ -0.79
IL6-208	ENST00000464710	GSTO1	P78417	241 aa		10.14	□□□□□ -0.79
IL6-208	ENST00000464710	MAP3K12	Q12852	859 aa		10.14	□□□□□ -0.79
IL6-208	ENST00000464710	CFAP100	Q494V2	611 aa		10.14	□□□□□ -0.79

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