RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462645.1

MICAL3-208, Transcript of microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 3, human

TSL 4

Gene MICAL3, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MICAL3-208	ENST00000462645	PTPN18	Q99952	460 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	CD209	Q9NNX6	404 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	TAF1	P21675	1872 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	TLR2	O60603	784 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	CETP	P11597	493 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	TNNI2	P48788	182 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	GNAI1	P63096	354 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	KRT24	Q2M2I5	525 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	KSR2	Q6VAB6	950 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	GJB1	P08034	283 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	IL1R1	P14778	569 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	RASA3	Q14644	834 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	MXD3	Q9BW11	206 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	GREM2	Q9H772	168 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	HTT	P42858	3142 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MICAL3-208	ENST00000462645	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	GJA8	P48165	433 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	UBXN2A	P68543	259 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	CCL15	Q16663	113 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	PRO3102	Q9H379	93 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	LAMB1	P07942	1786 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645		H7C1W4	665 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	GJA5	P36382	358 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	CEP290	O15078	2479 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	CSF1R	P07333	972 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	ITGA6	P23229	1130 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	GRK4	P32298	578 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	CHRND	Q07001	517 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.49	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	STK31	Q9BXU1	1019 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	COL4A1	P02462	1669 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	IGKV5-2	P06315	115 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	PPAT	Q06203	517 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	PPIL2	Q13356	520 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	VGLL4	Q14135	290 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	CERS5	Q8N5B7	392 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	FZD1	Q9UP38	647 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	BMP8B	P34820	402 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MICAL3-208	ENST00000462645	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25

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