RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.19■■□□□ 1.62
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SH3BP2-204ENST00000452765 KLHL34Q8N239 644 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-204ENST00000452765 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.18■■□□□ 1.62
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SH3BP2-204ENST00000452765 GTF2IP78347 998 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-204ENST00000452765 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
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SH3BP2-204ENST00000452765 LCORLQ8N3X6 602 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-204ENST00000452765 AIDAQ96BJ3 306 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-204ENST00000452765 SNED1Q8TER0 1413 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-204ENST00000452765 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
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