RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451506.5

PTPRN-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 466 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-209ENST00000451506 IL1R1P14778 569 aa21.77■■□□□ 1.08
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PTPRN-209ENST00000451506 MAP3K11Q16584 847 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 A0A1B0GUL6 1792 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRN-209ENST00000451506 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.76■■□□□ 1.07
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PTPRN-209ENST00000451506 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRN-209ENST00000451506 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.75■■□□□ 1.07
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PTPRN-209ENST00000451506 F6X3S4 739 aa21.74■■□□□ 1.07
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PTPRN-209ENST00000451506 INHBEP58166 350 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRN-209ENST00000451506 CFAP100Q494V2 611 aa21.74■■□□□ 1.07
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PTPRN-209ENST00000451506 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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PTPRN-209ENST00000451506 F8W031 263 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PTPRN-209ENST00000451506 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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PTPRN-209ENST00000451506 IFNL1Q8IU54 200 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRN-209ENST00000451506 WDR63Q8IWG1 891 aa21.73■■□□□ 1.07
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PTPRN-209ENST00000451506 UNCXA6NJT0 531 aa21.72■■□□□ 1.07
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PTPRN-209ENST00000451506 WNK4Q96J92 1243 aa21.72■■□□□ 1.07
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PTPRN-209ENST00000451506 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRN-209ENST00000451506 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PTPRN-209ENST00000451506 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRN-209ENST00000451506 JAG2Q9Y219 1238 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRN-209ENST00000451506 LAMB1P07942 1786 aa21.71■■□□□ 1.07
PTPRN-209ENST00000451506 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 GRM8O00222 908 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 VEZTQ9HBM0 779 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 PLIN1O60240 522 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTPRN-209ENST00000451506 MRS2Q9HD23 443 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
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PTPRN-209ENST00000451506 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
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PTPRN-209ENST00000451506 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 TRIM17Q9Y577 477 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 UBE4AQ14139 1066 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRN-209ENST00000451506 HTTP42858 3142 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 ALDH1L1O75891 902 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 GYG1P46976 350 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 KAZALD1Q96I82 304 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 PTPN18Q99952 460 aa21.64■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
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PTPRN-209ENST00000451506 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
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PTPRN-209ENST00000451506 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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PTPRN-209ENST00000451506 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 OPTNQ96CV9 577 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRN-209ENST00000451506 ELP3Q9H9T3 547 aa21.6■■□□□ 1.05
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