RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439512.5

TOM1-207, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 3

Gene TOM1, Length 800 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-207ENST00000439512 ATP2B3Q16720 1220 aa20.48■□□□□ 0.87
TOM1-207ENST00000439512 CERS5Q8N5B7 392 aa20.48■□□□□ 0.87
TOM1-207ENST00000439512 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.48■□□□□ 0.87
TOM1-207ENST00000439512 TRAF5O00463 557 aa20.47■□□□□ 0.87
TOM1-207ENST00000439512 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.873e-6■■□□□ 13
TOM1-207ENST00000439512 SCARF1Q14162 830 aa20.47■□□□□ 0.87
TOM1-207ENST00000439512 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TOM1-207ENST00000439512 CREBZFQ9NS37 354 aa20.47■□□□□ 0.87
TOM1-207ENST00000439512 TFCP2Q12800 502 aa20.46■□□□□ 0.87
TOM1-207ENST00000439512 POLA2Q14181 598 aa20.46■□□□□ 0.87
TOM1-207ENST00000439512 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.46■□□□□ 0.87
TOM1-207ENST00000439512 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.46■□□□□ 0.87
TOM1-207ENST00000439512 USP48Q86UV5 1035 aa20.46■□□□□ 0.87
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TOM1-207ENST00000439512 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.46■□□□□ 0.87
TOM1-207ENST00000439512 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.46■□□□□ 0.87
TOM1-207ENST00000439512 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.46■□□□□ 0.87
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TOM1-207ENST00000439512 PDE3AQ14432 1141 aa20.45■□□□□ 0.86
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TOM1-207ENST00000439512 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.44■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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TOM1-207ENST00000439512 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.43■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 MMP14P50281 582 aa20.43■□□□□ 0.86
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TOM1-207ENST00000439512 CEP85Q6P2H3 762 aa20.43■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 DLK2Q6UY11 383 aa20.43■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.43■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.43■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.43■□□□□ 0.86
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TOM1-207ENST00000439512 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 CST9Q5W186 159 aa20.42■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.42■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.42■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 GGA3Q9NZ52 723 aa20.42■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.42■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 WNT10BO00744 389 aa20.41■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 JMYQ8N9B5 988 aa20.41■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 CNTNAP1P78357 1384 aa20.41■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 A0A1B0GUL7 405 aa20.4■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 DLGAP5Q15398 846 aa20.4■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 SULF1Q8IWU6 871 aa20.4■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.4■□□□□ 0.86
TOM1-207ENST00000439512 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
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TOM1-207ENST00000439512 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
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TOM1-207ENST00000439512 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.39■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 XAGE2Q96GT9 111 aa20.39■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.38■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 GRIK5Q16478 980 aa20.38■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 CFAP100Q494V2 611 aa20.38■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 CCDC102BQ68D86 513 aa20.38■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.38■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 RASSF10A6NK89 507 aa20.37■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 GORABQ5T7V8 394 aa20.37■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 ZBTB22O15209 634 aa20.36■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.36■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.36■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 PCNTO95613 3336 aa20.35■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.35■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.35■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.35■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.35■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.35■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 AOX1Q06278 1338 aa20.34■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.34■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 SPDYE6P0CI01 402 aa20.34■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 GPR108Q9NPR9 543 aa20.34■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.34■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 SEMA3EO15041 775 aa20.33■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 MYO1BO43795 1136 aa20.33■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 HMMRO75330 724 aa20.33■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 CRKP46108 304 aa20.33■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 TNNI3KQ59H18 835 aa20.33■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.33■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 CDCA5Q96FF9 252 aa20.33■□□□□ 0.85
TOM1-207ENST00000439512 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.33■□□□□ 0.85
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