RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 CERS5Q8N5B7 392 aa24.54■■□□□ 1.52
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
UBXN4-202ENST00000415164 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.54■■□□□ 1.52
UBXN4-202ENST00000415164 GPR25O00155 361 aa24.53■■□□□ 1.52
UBXN4-202ENST00000415164 MYO1BO43795 1136 aa24.53■■□□□ 1.52
UBXN4-202ENST00000415164 CFAP100Q494V2 611 aa24.53■■□□□ 1.52
UBXN4-202ENST00000415164 BEND3Q5T5X7 828 aa24.52■■□□□ 1.52
UBXN4-202ENST00000415164 WDR63Q8IWG1 891 aa24.52■■□□□ 1.52
UBXN4-202ENST00000415164 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.52■■□□□ 1.52
UBXN4-202ENST00000415164 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
UBXN4-202ENST00000415164 ANP32CO43423 234 aa24.51■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 SPRYD7Q5W111 196 aa24.51■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.51■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.51■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 FKTNO75072 461 aa24.5■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.5■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.49■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.49■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.49■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 GRM8O00222 908 aa24.48■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 IL1R1P14778 569 aa24.48■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.48■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.47■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 SPDYE6P0CI01 402 aa24.47■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.47■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.47■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.46■■□□□ 1.51
UBXN4-202ENST00000415164 AOX1Q06278 1338 aa24.45■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 ALDH1A1P00352 501 aa24.45■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.45■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 WNK4Q96J92 1243 aa24.45■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 IFNL1Q8IU54 200 aa24.44■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.44■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.44■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 GYG1P46976 350 aa24.43■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 RASA3Q14644 834 aa24.43■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.43■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 MAP3K11Q16584 847 aa24.42■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 SUCLG2Q96I99 432 aa24.42■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 TRIM17Q9Y577 477 aa24.42■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 INHBEP58166 350 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 A0A1B0GUL6 1792 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 ALDH1L1O75891 902 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 VPS37DQ86XT2 251 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 ELP3Q9H9T3 547 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
UBXN4-202ENST00000415164 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 UBE4AQ14139 1066 aa24.39■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 CACNA1FO60840 1977 aa24.38■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.38■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 TNFAIP1Q13829 316 aa24.38■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.38■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.38■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.37■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 GJA5P36382 358 aa24.37■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.36■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.36■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 CRKP46108 304 aa24.35■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 METTL24Q5JXM2 366 aa24.35■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.35■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.35■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 OPTNQ96CV9 577 aa24.35■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.35■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.35■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 TNNI2P48788 182 aa24.34■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 CRHR2Q13324 411 aa24.34■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.34■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 ERO1AQ96HE7 468 aa24.34■■□□□ 1.49
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.34■■□□□ 1.49
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