RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.27■■□□□ 1.48
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ODC1-202ENST00000405333 MAST3O60307 1309 aa24.27■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.27■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 UTRNP46939 3433 aa24.27■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
ODC1-202ENST00000405333 DPEP1P16444 411 aa24.27■■□□□ 1.48
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ODC1-202ENST00000405333 WASHC4Q2M389 1173 aa24.26■■□□□ 1.47
ODC1-202ENST00000405333 MPNDQ8N594 471 aa24.26■■□□□ 1.47
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ODC1-202ENST00000405333 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.25■■□□□ 1.47
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ODC1-202ENST00000405333 PDE6AP16499 860 aa24.25■■□□□ 1.47
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ODC1-202ENST00000405333 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.472e-6■■■□□ 14.7
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ODC1-202ENST00000405333 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.24■■□□□ 1.47
ODC1-202ENST00000405333 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.24■■□□□ 1.47
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ODC1-202ENST00000405333 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.23■■□□□ 1.47
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ODC1-202ENST00000405333 SLC4A3P48751 1232 aa24.23■■□□□ 1.47
ODC1-202ENST00000405333 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.23■■□□□ 1.47
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ODC1-202ENST00000405333 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
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ODC1-202ENST00000405333 APPBP2Q92624 585 aa24.22■■□□□ 1.47
ODC1-202ENST00000405333 MAP4K1Q92918 833 aa24.22■■□□□ 1.47
ODC1-202ENST00000405333 CD209Q9NNX6 404 aa24.22■■□□□ 1.47
ODC1-202ENST00000405333 PTGER2P43116 358 aa24.22■■□□□ 1.47
ODC1-202ENST00000405333 MAP3K12Q12852 859 aa24.22■■□□□ 1.47
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ODC1-202ENST00000405333 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.2■■□□□ 1.46
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ODC1-202ENST00000405333 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.19■■□□□ 1.46
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ODC1-202ENST00000405333 GRIK5Q16478 980 aa24.18■■□□□ 1.46
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ODC1-202ENST00000405333 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.18■■□□□ 1.46
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ODC1-202ENST00000405333 ANAPC15P60006 121 aa24.14■■□□□ 1.45
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ODC1-202ENST00000405333 RABEP1Q15276 862 aa24.13■■□□□ 1.45
ODC1-202ENST00000405333 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.13■■□□□ 1.45
ODC1-202ENST00000405333 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
ODC1-202ENST00000405333 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
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ODC1-202ENST00000405333 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.13■■□□□ 1.45
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ODC1-202ENST00000405333 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.12■■□□□ 1.45
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