RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXD12-201ENST00000404162 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 UNCXA6NJT0 531 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 IFT57Q9NWB7 429 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 AOX1Q06278 1338 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 F8W031 263 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 SNAP23O00161 211 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP100Q494V2 611 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF333Q96JL9 665 aa24.81■■□□□ 1.56
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HOXD12-201ENST00000404162 H7C1W4 665 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 ITGA6P23229 1130 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 GNAI1P63096 354 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.8■■□□□ 1.56
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HOXD12-201ENST00000404162 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 KCNJ4P48050 445 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
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HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 SPDYE6P0CI01 402 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 ELP3Q9H9T3 547 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD12-201ENST00000404162 MYO1BO43795 1136 aa24.77■■□□□ 1.56
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HOXD12-201ENST00000404162 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 OTOFQ9HC10 1997 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 TAF5LO75529 589 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 CSF1RP07333 972 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 JAG2Q9Y219 1238 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 APAF1O14727 1248 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 NBPF11Q86T75 865 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 OTUD5Q96G74 571 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 H0YGN5 161 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 CASP7P55210 303 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 G2E3Q7L622 706 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 IL1R1P14778 569 aa24.72■■□□□ 1.55
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HOXD12-201ENST00000404162 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
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HOXD12-201ENST00000404162 GCKRQ14397 625 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GUL6 1792 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF6Q15052 776 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 CCL15Q16663 113 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 SZT2Q5T011 3432 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 STK31Q9BXU1 1019 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 CHRDL2Q6WN34 429 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 TEPSINQ96N21 525 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 GTF2A2P52657 109 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 VGLL4Q14135 290 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 MAP3K9P80192 1104 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 TNFAIP1Q13829 316 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 SLC4A2P04920 1241 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
HOXD12-201ENST00000404162 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 PLIN1O60240 522 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 TLR2O60603 784 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 FOXO4P98177 505 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD12-201ENST00000404162 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
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