RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 UTYO14607 1347 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 AOX1Q06278 1338 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 PRKG1Q13976 671 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 FZD1Q9UP38 647 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 GYG1P46976 350 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 CSRNP1Q96S65 589 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 PTPRCP08575 1304 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 TRPA1O75762 1119 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 FKBP1BP68106 108 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 LRRC24Q50LG9 513 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 RNF186Q9NXI6 227 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 DLGAP5Q15398 846 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 CLRN2A0PK11 232 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 CFAP100Q494V2 611 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 USP44Q9H0E7 712 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRK-208ENST00000392449 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 MMP14P50281 582 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 UBE4AQ14139 1066 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 SPDYE6P0CI01 402 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 NF2P35240 595 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 DGKZQ13574 1117 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 METTL24Q5JXM2 366 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 GRIK5Q16478 980 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 VEZTQ9HBM0 779 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PTPRK-208ENST00000392449 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 MYO1BO43795 1136 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 PDE8BO95263 885 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 TBC1D8O95759 1140 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 BCAMP50895 628 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 VPS37DQ86XT2 251 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 CCER2I3L3R5 266 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 RASA3Q14644 834 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 CRKP46108 304 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 OTOFQ9HC10 1997 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 FGFR2P21802 821 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 SPRYD7Q5W111 196 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 SIL1Q9H173 461 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-208ENST00000392449 EYA2O00167 538 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-208ENST00000392449 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-208ENST00000392449 TM4SF4P48230 202 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-208ENST00000392449 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-208ENST00000392449 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-208ENST00000392449 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-208ENST00000392449 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-208ENST00000392449 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms