RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 KIF16BQ96L93 1317 aa29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 GYG1P46976 350 aa29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGAP45Q92619 1136 aa29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 METTL24Q5JXM2 366 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 ZIC5Q96T25 663 aa29.48■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 BEGAINQ9BUH8 593 aa29.47■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 F8W031 263 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 VGLL2Q8N8G2 317 aa29.46■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 FAM205AQ6ZU69 1335 aa29.45■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa29.45■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 NOGQ13253 232 aa29.45■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa29.45■■■□□ 2.31
FAAP20-201ENST00000378543 ECM29Q5VYK3 1845 aa29.45■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 PDE8BO95263 885 aa29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 DLGAP5Q15398 846 aa29.44■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 MTMR14Q8NCE2 650 aa29.43■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 FKBP1BP68106 108 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 MOB2Q70IA6 237 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 FBXO33Q7Z6M2 555 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC102AQ96A19 550 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 TSKSQ9UJT2 592 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 HDAC5Q9UQL6 1122 aa29.42■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 CFAP100Q494V2 611 aa29.41■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 ARAP2Q8WZ64 1704 aa29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 EYA2O00167 538 aa29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 MFSD14BQ5SR56 506 aa29.4■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 SLC10A3P09131 477 aa29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 MEIS3Q99687 375 aa29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
FAAP20-201ENST00000378543 UBE2Q2LH0YL09 131 aa29.38■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 FGFR2P21802 821 aa29.38■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 VPS37DQ86XT2 251 aa29.38■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 AOX1Q06278 1338 aa29.38■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 SPDYE2BA6NHP3 402 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 CAPN15O75808 1086 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 BCAR3O75815 825 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 SPDYE6P0CI01 402 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 CAVIN4Q5BKX8 364 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.37■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 CA12O43570 354 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 NF2P35240 595 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 RASAL3Q86YV0 1011 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 TNNQ9UQP3 1299 aa29.36■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 CLRN2A0PK11 232 aa29.35■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 BCAMP50895 628 aa29.35■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP29.35■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 SIL1Q9H173 461 aa29.35■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 DEFB129Q9H1M3 183 aa29.35■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 GRIK5Q16478 980 aa29.34■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 MYO1BO43795 1136 aa29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM27P14373 513 aa29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 AKAP11Q9UKA4 1901 aa29.33■■■□□ 2.29
FAAP20-201ENST00000378543 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 PRKG1Q13976 671 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 SERPINA10Q9UK55 444 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 FBXO3Q9UK99 471 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 MYH13Q9UKX3 1938 aa29.32■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 CIAO1O76071 339 aa29.31■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 LPIN2Q92539 896 aa29.31■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 CSRNP1Q96S65 589 aa29.31■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 VEZTQ9HBM0 779 aa29.31■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 GNAI3P08754 354 aa29.3■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 SLC5A1P13866 664 aa29.3■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 ARMC9Q7Z3E5 817 aa29.29■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa29.29■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 FZD1Q9UP38 647 aa29.29■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa29.29■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 SSC5DA1L4H1 1573 aa29.28■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 CRKP46108 304 aa29.28■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.28■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
FAAP20-201ENST00000378543 COPRSQ9NQ92 184 aa29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms