RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376303.6

SYP-202, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-202ENST00000376303 CERS5Q8N5B7 392 aa22.21■■□□□ 1.15
SYP-202ENST00000376303 UBE4AQ14139 1066 aa22.2■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 DLGAP5Q15398 846 aa22.2■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.2■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.2■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 CSRNP1Q96S65 589 aa22.2■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 MOB2Q70IA6 237 aa22.19■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.18■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 RNF186Q9NXI6 227 aa22.18■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.17■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 TRPA1O75762 1119 aa22.17■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.17■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.17■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.16■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 F8W031 263 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 MYO1BO43795 1136 aa22.15■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 CFAP100Q494V2 611 aa22.15■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.15■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.15■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.15■■□□□ 1.14
SYP-202ENST00000376303 GYG1P46976 350 aa22.14■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.14■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.14■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 USP44Q9H0E7 712 aa22.14■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 JAG2Q9Y219 1238 aa22.14■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.14■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.13■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 SPDYE6P0CI01 402 aa22.13■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 DGKZQ13574 1117 aa22.13■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.13■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.12■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.12■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.12■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.12■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 PRKG1Q13976 671 aa22.11■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 LRRC24Q50LG9 513 aa22.11■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 METTL24Q5JXM2 366 aa22.11■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 VPS37DQ86XT2 251 aa22.11■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 CCER2I3L3R5 266 aa22.1■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 PDE8BO95263 885 aa22.1■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.1■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 CLRN2A0PK11 232 aa22.09■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 TM4SF4P48230 202 aa22.09■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 MAP3K11Q16584 847 aa22.09■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.09■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.09■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.09■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 VEZTQ9HBM0 779 aa22.09■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.09■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.08■■□□□ 1.13
SYP-202ENST00000376303 SREBF2Q12772 1141 aa22.07■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.07■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 UNCXA6NJT0 531 aa22.06■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 TNFAIP1Q13829 316 aa22.06■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.06■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.05■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.05■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 SPRYD7Q5W111 196 aa22.05■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.05■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 FZD1Q9UP38 647 aa22.05■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.05■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 AOX1Q06278 1338 aa22.05■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 KIF16BQ96L93 1317 aa22.05■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 RASA3Q14644 834 aa22.04■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 LAMB1P07942 1786 aa22.04■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 EYA2O00167 538 aa22.03■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 TBC1D8O95759 1140 aa22.03■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 FGFR2P21802 821 aa22.03■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 CRKP46108 304 aa22.03■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 RGS19P49795 217 aa22.03■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SYP-202ENST00000376303 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
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