RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373436.5

RALGPS1-204, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 1,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-204ENST00000373436 ERC2O15083 957 aa24.3■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 SCN9AQ15858 1988 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 IL1R1P14778 569 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 LMNB1P20700 586 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 CASC1Q6TDU7 716 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.29■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 ECE2O60344 883 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 ATP5JP18859 108 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 RASGRF1Q13972 1273 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 SCARF1Q14162 830 aa24.28■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 MCAMP43121 646 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 PODNQ7Z5L7 613 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 NIM1KQ8IY84 436 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 JDP2Q8WYK2 163 aa24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
RALGPS1-204ENST00000373436 PI16Q6UXB8 463 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 AK9Q5TCS8 1911 aa24.26■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 YDJCA8MPS7 323 aa24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 SEMA3EO15041 775 aa24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 ZBTB22O15209 634 aa24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.25■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 PSME4Q14997 1843 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 SPATA5Q8NB90 893 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 SNRKQ9NRH2 765 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 CNTROBQ8N137 903 aa24.24■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 HAUS7Q99871 368 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 RNF181Q9P0P0 153 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 JAG2Q9Y219 1238 aa24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 CHMLP26374 656 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 ZAP70P43403 619 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 GTF2IP78347 998 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.21■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
RALGPS1-204ENST00000373436 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 FZD9O00144 591 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 FBXW7Q969H0 707 aa24.2■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 USP17L3A6NCW0 530 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 USP17L4A6NCW7 530 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 RAD17O75943 681 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 GOLIM4O00461 696 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 CXCL9Q07325 125 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.18■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 EVI5LQ96CN4 794 aa24.17■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 PSMD14O00487 310 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 DACT2Q5SW24 774 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 DOCK2Q92608 1830 aa24.16■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 REC8O95072 547 aa24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 MXD3Q9BW11 206 aa24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 ABCF2Q9UG63 623 aa24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RALGPS1-204ENST00000373436 VIL1P09327 827 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
RALGPS1-204ENST00000373436 TNIP1Q15025 636 aa24.14■■□□□ 1.45
RALGPS1-204ENST00000373436 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
RALGPS1-204ENST00000373436 CERS5Q8N5B7 392 aa24.14■■□□□ 1.45
RALGPS1-204ENST00000373436 USP26Q9BXU7 913 aa24.14■■□□□ 1.45
RALGPS1-204ENST00000373436 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
RALGPS1-204ENST00000373436 MYH7P12883 1935 aa24.13■■□□□ 1.45
RALGPS1-204ENST00000373436 PRDX5P30044 214 aa24.12■■□□□ 1.45
RALGPS1-204ENST00000373436 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
RALGPS1-204ENST00000373436 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.12■■□□□ 1.45
RALGPS1-204ENST00000373436 GRIK5Q16478 980 aa24.11■■□□□ 1.45
RALGPS1-204ENST00000373436 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.11■■□□□ 1.45
RALGPS1-204ENST00000373436 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.2 ms