RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373113.7

TREM2-202, Transcript of triggering receptor expressed on myeloid cells 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TREM2, Length 1,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM2-202ENST00000373113 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
TREM2-202ENST00000373113 CACNA1FO60840 1977 aa16.46■□□□□ 0.23
TREM2-202ENST00000373113 SREBF2Q12772 1141 aa16.46■□□□□ 0.23
TREM2-202ENST00000373113 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
TREM2-202ENST00000373113 FBXW7Q969H0 707 aa16.46■□□□□ 0.23
TREM2-202ENST00000373113 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa16.46■□□□□ 0.23
TREM2-202ENST00000373113 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa16.46■□□□□ 0.23
TREM2-202ENST00000373113 SPEF2Q9C093 1822 aa16.46■□□□□ 0.23
TREM2-202ENST00000373113 TAF5LO75529 589 aa16.45■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 INHBEP58166 350 aa16.45■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 DLGAP5Q15398 846 aa16.45■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.44■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 SPDYE6P0CI01 402 aa16.44■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 KCNJ4P48050 445 aa16.44■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.44■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa16.44■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 HTTP42858 3142 aa16.44■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 ZNF521Q96K83 1311 aa16.44■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 SSC5DA1L4H1 1573 aa16.43■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 FKTNO75072 461 aa16.43■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 ALDH1A1P00352 501 aa16.43■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.43■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 F6X3S4 739 aa16.42■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 PRKG1Q13976 671 aa16.42■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 CFAP100Q494V2 611 aa16.42■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 LMBR1LQ6UX01 489 aa16.42■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 IFNL1Q8IU54 200 aa16.42■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 SLC10A4Q96EP9 437 aa16.42■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.42■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 FZD1Q9UP38 647 aa16.42■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 AOX1Q06278 1338 aa16.42■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 GRM8O00222 908 aa16.41■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16.41■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.41■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 WNK4Q96J92 1243 aa16.41■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 USP2O75604 605 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 CLMNQ96JQ2 1002 aa16.4■□□□□ 0.22
TREM2-202ENST00000373113 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.39■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 MYO1BO43795 1136 aa16.39■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 ALDH1L1O75891 902 aa16.39■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 UBE4AQ14139 1066 aa16.39■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa16.39■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 KAZALD1Q96I82 304 aa16.39■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 CLRN2A0PK11 232 aa16.38■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 GJA5P36382 358 aa16.38■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 RASA3Q14644 834 aa16.38■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.38■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 A0A1B0GUL6 1792 aa16.38■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 LAMB1P07942 1786 aa16.37■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 F8W031 263 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.37■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 CDCA7LQ96GN5 454 aa16.37■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 TEPSINQ96N21 525 aa16.37■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.37■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.37■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 UTYO14607 1347 aa16.37■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 CENPFP49454 3210 aa16.36■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 IREB2P48200 963 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 OTOP1Q7RTM1 612 aa16.36■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 PTPN18Q99952 460 aa16.36■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.36■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.36■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 E9PSI1 815 aa16.35■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 MFSD14BQ5SR56 506 aa16.35■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.35■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa16.35■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 MS4A4AQ96JQ5 239 aa16.35■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 JAG2Q9Y219 1238 aa16.35■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 ECM29Q5VYK3 1845 aa16.35■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 BRCA2P51587 3418 aa16.34■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 GYG1P46976 350 aa16.34■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 SLFN5Q08AF3 891 aa16.34■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 SUCLG2Q96I99 432 aa16.34■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa16.34■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 VEZTQ9HBM0 779 aa16.34■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TREM2-202ENST00000373113 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
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