RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM161BQ96MY7 647 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 PLVAPQ9BX97 442 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 MUC3BQ9H195 1237 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 SOX13Q9UN79 622 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 AK5Q9Y6K8 562 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 KRBA1A5PL33 1030 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 FURINP09958 794 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 EPHA1P21709 976 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 ITPKAP23677 461 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 PSMD2Q13200 908 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 C12orf49Q9H741 205 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 PPME1Q9Y570 386 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM177BA6PVY3 158 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC01387J3KSC0 135 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 PIK3R2O00459 728 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 CDC25BP30305 580 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 FCGRTP55899 365 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 Q8N3U1 123 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF576Q9H609 170 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0A0MRY4 1105 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 H3BRJ5 948 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 SORBS3O60504 671 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 GSTT1P30711 240 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 CABP4P57796 275 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 SETDB1Q15047 1291 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM229AH3BQW9 127 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L7P0C7H9 530 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 COL8A1P27658 744 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDH1Q08174 1060 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 IKBKEQ14164 716 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXO11Q86XK2 927 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF428Q96B54 188 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 MRS2Q9HD23 443 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 UNCXA6NJT0 531 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 TM4SF5O14894 197 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 FSCN2O14926 492 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 RAC1P63000 192 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 PIP4K2BP78356 416 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 HGSNATQ68CP4 663 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 WNT8BQ93098 351 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 CTSHP09668 335 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 FAAP100Q0VG06 881 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 B3GALT4O96024 378 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 ITGAEP38570 1179 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 ARL4DP49703 201 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 BCL11AQ9H165 835 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 DLL1O00548 723 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 ELNP15502 786 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 GRIK4Q16099 956 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 USP31Q70CQ4 1352 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXO24O75426 580 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 VAMP1P23763 118 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms