RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGMS1-201ENST00000361543 CYP4F22Q6NT55 531 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA0825Q8IV33 1275 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-201ENST00000361543 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.6□□□□□ -0.87
SGMS1-201ENST00000361543 SASH1O94885 1247 aa9.59□□□□□ -0.87
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SGMS1-201ENST00000361543 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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SGMS1-201ENST00000361543 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 SSC5DA1L4H1 1573 aa9.54□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 MYH2Q9UKX2 1941 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 CLRN2A0PK11 232 aa9.53□□□□□ -0.88
SGMS1-201ENST00000361543 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
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