RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 SASH1O94885 1247 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 CELF2O95319 508 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMP14P50281 582 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASSF10A6NK89 507 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 WNT10BO00744 389 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC5A1P13866 664 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS37DQ86XT2 251 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 PANK1Q8TE04 598 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 LPIN2Q92539 896 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.33■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCAMP50895 628 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP2B3Q16720 1220 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SULF1Q8IWU6 871 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF408Q9H9D4 720 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 TLL2Q9Y6L7 1015 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 F8W031 263 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 THSD7BQ9C0I4 1608 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 VEGFBP49765 207 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCNTO95613 3336 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB115Q30KQ5 88 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAPCD2Q86UD0 394 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDCA5Q96FF9 252 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLA2Q14181 598 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 DLGAP5Q15398 846 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFCP2Q12800 502 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRIK5Q16478 980 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP100Q494V2 611 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPDYE6P0CI01 402 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 MS4A1P11836 297 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADORA1P30542 326 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP8B2P98198 1209 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSH3Q8TE77 659 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 AOX1Q06278 1338 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHKA1P46020 1223 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 HHIPL1Q96JK4 782 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAPNS2Q96L46 248 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GUL7 405 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 HUNKP57058 714 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP85Q6P2H3 762 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ECE1P42892 770 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRKP46108 304 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIMM10P62072 90 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC102BQ68D86 513 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 COG6Q9Y2V7 657 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLRN2A0PK11 232 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB22O15209 634 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRM1Q13255 1194 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 XAGE2Q96GT9 111 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEMA3EO15041 775 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO1BO43795 1136 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPDYE2Q495Y8 402 aa24.17■■□□□ 1.46
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