RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317216.2

EGR3-201, Transcript of early growth response 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene EGR3, Length 4,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3-201ENST00000317216 NEK1Q96PY6 1258 aa14.57□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 AK2P54819 239 aa14.57□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.57□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 MBD3O95983 291 aa14.57□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 ANKRD1Q15327 319 aa14.57□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 APPBP2Q92624 585 aa14.57□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.57□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.57□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 KIF3AQ9Y496 699 aa14.57□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.57□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 ZNF609O15014 1411 aa14.57□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 NRAPQ86VF7 1730 aa14.56□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 JAG2Q9Y219 1238 aa14.56□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 C6orf229H3BNL8 230 aa14.56□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 MSL1Q68DK7 614 aa14.56□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 ATRNO75882 1429 aa14.56□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.56□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.56□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 ZNF213O14771 459 aa14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 TDO2P48775 406 aa14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 GPAA1O43292 621 aa14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 RUFY3Q7L099 469 aa14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 NAPBQ9H115 298 aa14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.55□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.54□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 CYP7A1P22680 504 aa14.54□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.54□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 OSBP2Q969R2 916 aa14.54□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 RASGRF1Q13972 1273 aa14.54□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 UBE4AQ14139 1066 aa14.54□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 VPS53Q5VIR6 699 aa14.54□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 NECTIN1Q15223 517 aa14.54□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 MAST3O60307 1309 aa14.54□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 FIBPO43427 364 aa14.53□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.53□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 NECAB1Q8N987 351 aa14.53□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 PDE6AP16499 860 aa14.53□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.53□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.52□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 VGLL3A8MV65 326 aa14.52□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 M0R2C6 588 aa14.52□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 MBD4O95243 580 aa14.52□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.52□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 CHST3Q7LGC8 479 aa14.52□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 BRF1Q92994 677 aa14.52□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 MAP7D2Q96T17 732 aa14.52□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.52□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 TSPY26PQ9H489 355 aa14.52□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.52□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 ABCC12Q96J65 1359 aa14.52□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 PAPPAQ13219 1627 aa14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 DTNBO60941 627 aa14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 GYS1P13807 737 aa14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 GLI3P10071 1580 aa14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 CYP21A2P08686 494 aa14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 STK32BQ9NY57 414 aa14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 UFL1O94874 794 aa14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 FOSBP53539 338 aa14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.51□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 CPLX1O14810 134 aa14.5□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.5□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 Q6ZUG5 572 aa14.5□□□□□ -0.09
EGR3-201ENST00000317216 ARMT1Q9H993 441 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms