RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306384.4

VAMP5-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP5, Length 689 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP5-201ENST00000306384 PLIN1O60240 522 aa22.17■■□□□ 1.14
VAMP5-201ENST00000306384 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VAMP5-201ENST00000306384 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.17■■□□□ 1.14
VAMP5-201ENST00000306384 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
VAMP5-201ENST00000306384 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
VAMP5-201ENST00000306384 LAMB1P07942 1786 aa22.17■■□□□ 1.14
VAMP5-201ENST00000306384 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
VAMP5-201ENST00000306384 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
VAMP5-201ENST00000306384 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.16■■□□□ 1.14
VAMP5-201ENST00000306384 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.16■■□□□ 1.14
VAMP5-201ENST00000306384 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
VAMP5-201ENST00000306384 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.15■■□□□ 1.14
VAMP5-201ENST00000306384 CSRNP1Q96S65 589 aa22.15■■□□□ 1.14
VAMP5-201ENST00000306384 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.15■■□□□ 1.14
VAMP5-201ENST00000306384 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.15■■□□□ 1.14
VAMP5-201ENST00000306384 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.14■■□□□ 1.14
VAMP5-201ENST00000306384 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.14■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 UBE4AQ14139 1066 aa22.14■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.13■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 RNF186Q9NXI6 227 aa22.13■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 JAG2Q9Y219 1238 aa22.13■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.12■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 DLGAP5Q15398 846 aa22.12■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.12■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 USP44Q9H0E7 712 aa22.12■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 AOX1Q06278 1338 aa22.11■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.11■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 F8W031 263 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 GYG1P46976 350 aa22.11■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 OTOFQ9HC10 1997 aa22.1■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.1■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 TRPA1O75762 1119 aa22.1■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 SPDYE6P0CI01 402 aa22.1■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 NF2P35240 595 aa22.1■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 CFAP100Q494V2 611 aa22.1■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 LRRC24Q50LG9 513 aa22.1■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.1■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.1■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.09■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
VAMP5-201ENST00000306384 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.07■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.07■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.07■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.07■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 CLRN2A0PK11 232 aa22.06■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 CCER2I3L3R5 266 aa22.06■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 DGKZQ13574 1117 aa22.06■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 PRKG1Q13976 671 aa22.06■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 METTL24Q5JXM2 366 aa22.06■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.06■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.06■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.06■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 FZD1Q9UP38 647 aa22.06■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 PDE8BO95263 885 aa22.05■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 MAP3K11Q16584 847 aa22.04■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.04■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.03■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 MYO1BO43795 1136 aa22.03■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 TM4SF4P48230 202 aa22.03■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 GRIK5Q16478 980 aa22.03■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 FGFR2P21802 821 aa22.02■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.02■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 VEZTQ9HBM0 779 aa22.02■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 KIF16BQ96L93 1317 aa22.02■■□□□ 1.12
VAMP5-201ENST00000306384 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 SPRYD7Q5W111 196 aa22.01■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 RASA3Q14644 834 aa22■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 EYA2O00167 538 aa21.99■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 CRKP46108 304 aa21.99■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 BCAMP50895 628 aa21.99■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.99■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.99■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 VPS37DQ86XT2 251 aa21.99■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.99■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 TBC1D8O95759 1140 aa21.98■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 SREBF2Q12772 1141 aa21.98■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.98■■□□□ 1.11
VAMP5-201ENST00000306384 UNCXA6NJT0 531 aa21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms