RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299576.9

AKIP1-201, Transcript of A-kinase interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene AKIP1, Length 1,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1-201ENST00000299576 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.34■□□□□ 0.53
AKIP1-201ENST00000299576 ECM29Q5VYK3 1845 aa18.34■□□□□ 0.53
AKIP1-201ENST00000299576 SRGAP3O43295 1099 aa18.33■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 CIAO1O76071 339 aa18.33■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 SASH1O94885 1247 aa18.33■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 CELF2O95319 508 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 FGFR2P21802 821 aa18.33■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 NBPF9Q3BBW0 867 aa18.33■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 FBXO33Q7Z6M2 555 aa18.33■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 COPRSQ9NQ92 184 aa18.33■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 FBXO3Q9UK99 471 aa18.33■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 FAM205AQ6ZU69 1335 aa18.32■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 F8W031 263 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 MTX1Q13505 466 aa18.32■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 CAVIN4Q5BKX8 364 aa18.32■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 VPS37DQ86XT2 251 aa18.32■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.32■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 HDAC9Q9UKV0 1011 aa18.32■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 RASSF10A6NK89 507 aa18.31■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 IL15P40933 162 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 BCAMP50895 628 aa18.31■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 DEFB115Q30KQ5 88 aa18.31■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 SULF1Q8IWU6 871 aa18.31■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 WNT10BO00744 389 aa18.3■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 SLC5A1P13866 664 aa18.3■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 VEGFBP49765 207 aa18.3■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 MMP14P50281 582 aa18.3■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 PANK1Q8TE04 598 aa18.3■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 LPIN2Q92539 896 aa18.3■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 CEP126Q9P2H0 1117 aa18.3■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa18.29■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 ATP2B3Q16720 1220 aa18.29■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 MFSD14BQ5SR56 506 aa18.29■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.29■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 TLL2Q9Y6L7 1015 aa18.29■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa18.28■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 RCAN3Q9UKA8 241 aa18.28■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa18.28■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 DLGAP5Q15398 846 aa18.27■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 SAPCD2Q86UD0 394 aa18.27■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 AIDAQ96BJ3 306 aa18.27■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 CDCA5Q96FF9 252 aa18.27■□□□□ 0.52
AKIP1-201ENST00000299576 CFAP100Q494V2 611 aa18.26■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 THSD7BQ9C0I4 1608 aa18.25■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 TFCP2Q12800 502 aa18.25■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 GRM1Q13255 1194 aa18.25■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 GRIK5Q16478 980 aa18.25■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 CYP4F22Q6NT55 531 aa18.25■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 MTMR14Q8NCE2 650 aa18.25■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 MS4A1P11836 297 aa18.24■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 ADORA1P30542 326 aa18.24■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa18.24■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa18.24■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 CAPNS2Q96L46 248 aa18.24■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 AOX1Q06278 1338 aa18.23■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18.23■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 SPDYE6P0CI01 402 aa18.23■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 HUNKP57058 714 aa18.23■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 TIMM10P62072 90 aa18.23■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 ATP8B2P98198 1209 aa18.23■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 POLA2Q14181 598 aa18.23■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 C2orf69Q8N8R5 385 aa18.23■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa18.22■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 CLRN2A0PK11 232 aa18.22■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 ECE1P42892 770 aa18.22■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 PHKA1P46020 1223 aa18.22■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 SSH3Q8TE77 659 aa18.22■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 SERPINA10Q9UK55 444 aa18.22■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 AKAP2Q9Y2D5 859 aa18.22■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 A0A1B0GUL7 405 aa18.21■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 MYO1BO43795 1136 aa18.21■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 MVPQ14764 893 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 HHIPL1Q96JK4 782 aa18.21■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 COG6Q9Y2V7 657 aa18.21■□□□□ 0.51
AKIP1-201ENST00000299576 CRKP46108 304 aa18.2■□□□□ 0.5
AKIP1-201ENST00000299576 CCDC102BQ68D86 513 aa18.2■□□□□ 0.5
AKIP1-201ENST00000299576 WDR66Q8TBY9 1149 aa18.2■□□□□ 0.5
AKIP1-201ENST00000299576 XAGE2Q96GT9 111 aa18.2■□□□□ 0.5
AKIP1-201ENST00000299576 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
AKIP1-201ENST00000299576 NEUROD6Q96NK8 337 aa18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.3 ms