RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 CD209Q9NNX6 404 aa32.19■■■□□ 2.74
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RP9-201ENST00000297157 GTF2IP78347 998 aa32.18■■■□□ 2.74
RP9-201ENST00000297157 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
RP9-201ENST00000297157 USP44Q9H0E7 712 aa32.17■■■□□ 2.74
RP9-201ENST00000297157 HDAC9Q9UKV0 1011 aa32.17■■■□□ 2.74
RP9-201ENST00000297157 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
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RP9-201ENST00000297157 CERS5Q8N5B7 392 aa32.14■■■□□ 2.74
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RP9-201ENST00000297157 CHMP3Q9Y3E7 222 aa32.1■■■□□ 2.73
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RP9-201ENST00000297157 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
RP9-201ENST00000297157 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa31.93■■■□□ 2.7
RP9-201ENST00000297157 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
RP9-201ENST00000297157 SLC10A4Q96EP9 437 aa31.93■■■□□ 2.7
RP9-201ENST00000297157 CLMNQ96JQ2 1002 aa31.93■■■□□ 2.7
RP9-201ENST00000297157 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
RP9-201ENST00000297157 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
RP9-201ENST00000297157 VEZTQ9HBM0 779 aa31.93■■■□□ 2.7
RP9-201ENST00000297157 ALDH1A1P00352 501 aa31.92■■■□□ 2.7
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