RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292377.3

GPC2-201, Transcript of glypican 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC2, Length 2,532 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2-201ENST00000292377 TAF1P21675 1872 aa21.6■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 ABCC12Q96J65 1359 aa21.6■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 RREB1Q92766 1687 aa21.6■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 CTDNEP1O95476 244 aa21.6■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 SLC5A1P13866 664 aa21.6■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.6■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 SPATA5Q8NB90 893 aa21.6■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 EP400Q96L91 3159 aa21.6■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 CHRNDQ07001 517 aa21.59■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.59■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.59■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.59■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 PFKFB2O60825 505 aa21.59■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 MYH7P12883 1935 aa21.58■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 APPP05067 770 aa21.58■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 RNF214Q8ND24 703 aa21.58■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 NBPF3Q9H094 633 aa21.58■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.58■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 LRP5O75197 1615 aa21.58■■□□□ 1.05
GPC2-201ENST00000292377 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.58■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.58■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.58■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 PDCP20941 246 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 INCENPQ9NQS7 918 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 TTC6Q86TZ1 520 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 ZNF213O14771 459 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 UBE2HP62256 183 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 ANTXR2P58335 489 aa21.56■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 UBE3CQ15386 1083 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 GNPATO15228 680 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 PRC1O43663 620 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.55■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.54■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 GYG1P46976 350 aa21.54■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 ARMT1Q9H993 441 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 H3BQV1 296 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 GUCY1B3Q02153 619 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 IFFO2Q5TF58 517 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 AIDAQ96BJ3 306 aa21.53■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 PRKAB2O43741 272 aa21.52■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 MBD4O95243 580 aa21.52■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.52■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.52■■□□□ 1.04
GPC2-201ENST00000292377 KRT85P78386 507 aa21.52■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 NCOA7Q8NI08 942 aa21.52■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 MCM5P33992 734 aa21.51■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.51■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 RESTQ13127 1097 aa21.51■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.51■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.51■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 RTL9Q8NET4 1388 aa21.51■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 BCORQ6W2J9 1755 aa21.5■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.5■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 RPS6KA4O75676 772 aa21.5■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 PHF14O94880 888 aa21.5■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 MAP3K12Q12852 859 aa21.5■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 SLC51AQ86UW1 340 aa21.5■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.5■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 SENP2Q9HC62 589 aa21.5■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 NARFQ9UHQ1 456 aa21.5■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.5■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 BTAF1O14981 1849 aa21.49■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.49■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.49■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.49■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 TSPY26PQ9H489 355 aa21.49■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.49■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 ATRNO75882 1429 aa21.49■■□□□ 1.03
GPC2-201ENST00000292377 B4E1Z4 1266 aa21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 260.7 ms