RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 MAP3K11Q16584 847 aa25.48■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.48■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 ADAM21Q9UKJ8 722 aa25.48■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 HOMEZQ8IX15 550 aa25.47■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 KAZALD1Q96I82 304 aa25.47■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 SKILP12757 684 aa25.47■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 FIBPO43427 364 aa25.46■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 MCCP23508 829 aa25.46■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 MTX1Q13505 466 aa25.46■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.46■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 GRM8O00222 908 aa25.46■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D8O95759 1140 aa25.46■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 TRDNQ13061 729 aa25.46■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.46■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 TUBB4AP04350 444 aa25.45■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 TPM1P09493 284 aa25.45■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 IL17RAQ96F46 866 aa25.45■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 SUCLG2Q96I99 432 aa25.45■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 STAP2Q9UGK3 403 aa25.45■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 RAB11FIP3O75154 756 aa25.45■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.45■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.44■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.44■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 LRRN4CLQ8ND94 238 aa25.44■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 UBXN4Q92575 508 aa25.44■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 UTYO14607 1347 aa25.44■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.43■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 GOLIM4O00461 696 aa25.43■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 SASH3O75995 380 aa25.43■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 F13A1P00488 732 aa25.43■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.43■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 CCZ1BP86790 482 aa25.43■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.43■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 MYD88Q99836 296 aa25.43■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.42■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.42■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.42■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.41■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.41■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 NBPF26B4DH59 902 aa25.41■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 NBPF14Q5TI25 921 aa25.41■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 SARM1Q6SZW1 724 aa25.41■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 NBPF15Q8N660 670 aa25.41■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa25.41■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.4■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 STX6O43752 255 aa25.4■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 EFCAB13Q8IY85 973 aa25.4■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 PIGBQ92521 554 aa25.4■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.4■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 GCKRQ14397 625 aa25.39■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.39■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.39■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PITX1-201ENST00000265340 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.38■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 RNF217Q8TC41 542 aa25.38■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 CCDC69A6NI79 296 aa25.38■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 RILPL2Q969X0 211 aa25.38■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 ARID5BQ14865 1188 aa25.37■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 SGSM3Q96HU1 749 aa25.37■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 PAPPAQ13219 1627 aa25.37■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.37■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.37■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.37■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.37■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 KCNQ2O43526 872 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 CAVIN2O95810 425 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 SYT1P21579 422 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 ITGB4P16144 1822 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 A1BGP04217 495 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-201ENST00000265340 PALD1Q9ULE6 856 aa25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms