RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 XAGE2Q96GT9 111 aa10.22□□□□□ -0.77
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HERC3-201ENST00000264345 H7C1W4 665 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 USPL1Q5W0Q7 1092 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 MFSD6Q6ZSS7 791 aa10.22□□□□□ -0.77
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HERC3-201ENST00000264345 TCIRG1Q13488 830 aa10.21□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa10.21□□□□□ -0.77
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HERC3-201ENST00000264345 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa10.21□□□□□ -0.78
HERC3-201ENST00000264345 SPTLC3Q9NUV7 552 aa10.21□□□□□ -0.78
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HERC3-201ENST00000264345 NR1I2O75469 434 aa10.2□□□□□ -0.78
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HERC3-201ENST00000264345 CCDC70Q6NSX1 233 aa10.2□□□□□ -0.78
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HERC3-201ENST00000264345 NUP133Q8WUM0 1156 aa10.2□□□□□ -0.78
HERC3-201ENST00000264345 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
HERC3-201ENST00000264345 WDR19Q8NEZ3 1342 aa10.2□□□□□ -0.78
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HERC3-201ENST00000264345 RTN1Q16799 776 aa10.18□□□□□ -0.78
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HERC3-201ENST00000264345 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
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HERC3-201ENST00000264345 IL25Q9H293 177 aa10.18□□□□□ -0.78
HERC3-201ENST00000264345 COL15A1P39059 1388 aa10.18□□□□□ -0.78
HERC3-201ENST00000264345 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
HERC3-201ENST00000264345 STIM1Q13586 685 aa10.18□□□□□ -0.78
HERC3-201ENST00000264345 PPP2R5BQ15173 497 aa10.18□□□□□ -0.78
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HERC3-201ENST00000264345 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
HERC3-201ENST00000264345 TIGD1Q96MW7 591 aa10.18□□□□□ -0.78
HERC3-201ENST00000264345 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
HERC3-201ENST00000264345 MAST3O60307 1309 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC3-201ENST00000264345 ZMYM6O95789 1325 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC3-201ENST00000264345 BIN1O00499 593 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC3-201ENST00000264345 CALM1P0DP23 149 aa10.17□□□□□ -0.78
HERC3-201ENST00000264345 CALM2P0DP24 149 aa10.17□□□□□ -0.78
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