RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262643.7

CCNE1-201, Transcript of cyclin E1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNE1, Length 2,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1-201ENST00000262643 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.38■■□□□ 1.81
CCNE1-201ENST00000262643 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.38■■□□□ 1.81
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CCNE1-201ENST00000262643 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.37■■□□□ 1.81
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CCNE1-201ENST00000262643 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
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CCNE1-201ENST00000262643 ATP2B3Q16720 1220 aa26.34■■□□□ 1.81
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CCNE1-201ENST00000262643 KRT26Q7Z3Y9 468 aa26.33■■□□□ 1.81
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CCNE1-201ENST00000262643 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.32■■□□□ 1.8
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CCNE1-201ENST00000262643 TRPM7Q96QT4 1865 aa26.31■■□□□ 1.8
CCNE1-201ENST00000262643 ADM5C9JUS6 153 aa26.31■■□□□ 1.8
CCNE1-201ENST00000262643 CST9Q5W186 159 aa26.31■■□□□ 1.8
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CCNE1-201ENST00000262643 SULF1Q8IWU6 871 aa26.29■■□□□ 1.8
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CCNE1-201ENST00000262643 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.25■■□□□ 1.79
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CCNE1-201ENST00000262643 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.24■■□□□ 1.79
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CCNE1-201ENST00000262643 CNTNAP1P78357 1384 aa26.24■■□□□ 1.79
CCNE1-201ENST00000262643 A0A1B0GUL7 405 aa26.24■■□□□ 1.79
CCNE1-201ENST00000262643 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
CCNE1-201ENST00000262643 CFAP100Q494V2 611 aa26.24■■□□□ 1.79
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CCNE1-201ENST00000262643 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.23■■□□□ 1.79
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CCNE1-201ENST00000262643 DEFB115Q30KQ5 88 aa26.22■■□□□ 1.79
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CCNE1-201ENST00000262643 CCDC102BQ68D86 513 aa26.21■■□□□ 1.79
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CCNE1-201ENST00000262643 TLL2Q9Y6L7 1015 aa26.21■■□□□ 1.79
CCNE1-201ENST00000262643 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
CCNE1-201ENST00000262643 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa26.2■■□□□ 1.78
CCNE1-201ENST00000262643 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
CCNE1-201ENST00000262643 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.19■■□□□ 1.78
CCNE1-201ENST00000262643 SPDYE6P0CI01 402 aa26.19■■□□□ 1.78
CCNE1-201ENST00000262643 VEGFBP49765 207 aa26.19■■□□□ 1.78
CCNE1-201ENST00000262643 JMYQ8N9B5 988 aa26.19■■□□□ 1.78
CCNE1-201ENST00000262643 SAPCD2Q86UD0 394 aa26.19■■□□□ 1.78
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