RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
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HOXD11-201ENST00000249504 GTF2IP78347 998 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD11-201ENST00000249504 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD11-201ENST00000249504 SKAP1Q86WV1 359 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXD11-201ENST00000249504 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
HOXD11-201ENST00000249504 MX1P20591 662 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXD11-201ENST00000249504 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.81■■□□□ 1.4
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HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.81■■□□□ 1.4
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HOXD11-201ENST00000249504 STAP2Q9UGK3 403 aa23.8■■□□□ 1.4
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HOXD11-201ENST00000249504 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
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HOXD11-201ENST00000249504 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
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HOXD11-201ENST00000249504 PDE1AP54750 535 aa23.79■■□□□ 1.4
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HOXD11-201ENST00000249504 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.77■■□□□ 1.4
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HOXD11-201ENST00000249504 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.75■■□□□ 1.39
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HOXD11-201ENST00000249504 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
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HOXD11-201ENST00000249504 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
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HOXD11-201ENST00000249504 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD11-201ENST00000249504 CERS5Q8N5B7 392 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXD11-201ENST00000249504 USP17L8P0C7I0 530 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXD11-201ENST00000249504 EPHX2P34913 555 aa23.7■■□□□ 1.38
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HOXD11-201ENST00000249504 OGFOD1Q8N543 542 aa23.7■■□□□ 1.38
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HOXD11-201ENST00000249504 SPATA5Q8NB90 893 aa23.69■■□□□ 1.38
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HOXD11-201ENST00000249504 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
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HOXD11-201ENST00000249504 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
HOXD11-201ENST00000249504 PI16Q6UXB8 463 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD11-201ENST00000249504 SNRKQ9NRH2 765 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD11-201ENST00000249504 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
HOXD11-201ENST00000249504 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
HOXD11-201ENST00000249504 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD11-201ENST00000249504 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD11-201ENST00000249504 DOCK2Q92608 1830 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD11-201ENST00000249504 KIF3CO14782 793 aa23.66■■□□□ 1.38
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