RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 LEMD3Q9Y2U8 911 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SSH3Q8TE77 659 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 DDNO94850 711 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 NIM1KQ8IY84 436 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 EYA3Q99504 573 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 IRS2Q9Y4H2 1338 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNJ4P48050 445 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS33BQ9H267 617 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 MROH5Q6ZUA9 1318 aa31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 HMMRO75330 724 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN30Q86W11 494 aa31.6■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SCN9AQ15858 1988 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE8BO95263 885 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ECE2O60344 883 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD17O75943 681 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNRF3Q9ULT6 936 aa31.59■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 GLTPD2A6NH11 291 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 OSBPL3Q9H4L5 887 aa31.58■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 MED23Q9ULK4 1368 aa31.57■■■□□ 2.65
CAPNS1-201ENST00000246533 CIAO1O76071 339 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 CXCL9Q07325 125 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 SDSP20132 328 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 LMBRD1Q9NUN5 540 aa31.57■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 NMRK2Q9NPI5 230 aa31.56■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 MCM2P49736 904 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 TERF1P54274 439 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ERC2O15083 957 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 IL15P40933 162 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 TFCP2Q12800 502 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 MCTP1Q6DN14 999 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 GJA3Q9Y6H8 435 aa31.55■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 SURF6O75683 361 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 SASH1O94885 1247 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 GYG1P46976 350 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE4AQ14139 1066 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO3Q9UK99 471 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 FGFR2P21802 821 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF6P56537 245 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 DPY19L2Q6NUT2 758 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP126Q9P2H0 1117 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa31.53■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 POTECB2RU33 542 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 G3V3G9 751 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 DCAF8Q5TAQ9 597 aa31.52■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 RRAGCQ9HB90 399 aa31.51■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP31.51■■■□□ 2.64
CAPNS1-201ENST00000246533 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP31.51■■■□□ 2.638e-8■■■■□ 23.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP31.51■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMD14O00487 310 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 MSNP26038 577 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
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CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 MXD3Q9BW11 206 aa31.49■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 CD209Q9NNX6 404 aa31.49■■■□□ 2.63
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CAPNS1-201ENST00000246533 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 JAG2Q9Y219 1238 aa31.48■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 BCAMP50895 628 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 GPC2Q8N158 579 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ADORA1P30542 326 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP2B3Q16720 1220 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 COA1Q9GZY4 146 aa31.47■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 SHTN1A0MZ66 631 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 OFD1O75665 1012 aa31.46■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
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CAPNS1-201ENST00000246533 APBB1O00213 710 aa31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 MBD3O95983 291 aa31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 LPIN2Q92539 896 aa31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 PDLIM2Q96JY6 352 aa31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 AK9Q5TCS8 1911 aa31.45■■■□□ 2.63
CAPNS1-201ENST00000246533 SCNN1DP51172 638 aa31.44■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
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CAPNS1-201ENST00000246533 ANAPC15P60006 121 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO33Q7Z6M2 555 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXW7Q969H0 707 aa31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GUL7 405 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF3CO14782 793 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 MCCP23508 829 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF804AQ7Z570 1209 aa31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC5A1P13866 664 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 IL1R1P14778 569 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF2IP78347 998 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 IL17RAQ96F46 866 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR90Q96KV7 1748 aa31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
CAPNS1-201ENST00000246533 VIL1P09327 827 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
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