RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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HOXC6-201ENST00000243108 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.46■■□□□ 1.03
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HOXC6-201ENST00000243108 CDCA5Q96FF9 252 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXC6-201ENST00000243108 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.39■■□□□ 1.01
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HOXC6-201ENST00000243108 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HOXC6-201ENST00000243108 RGMBQ6NW40 437 aa21.32■■□□□ 1
HOXC6-201ENST00000243108 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.31■■□□□ 1
HOXC6-201ENST00000243108 LBX1P52954 281 aa21.31■■□□□ 1
HOXC6-201ENST00000243108 GRIK5Q16478 980 aa21.31■■□□□ 1
HOXC6-201ENST00000243108 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.31■■□□□ 1
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