RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 ADM5C9JUS6 153 aa38.16■■■■□ 3.7
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INO80B-201ENST00000233331 FBXO33Q7Z6M2 555 aa38.16■■■■□ 3.7
INO80B-201ENST00000233331 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP38.16■■■■□ 3.7
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INO80B-201ENST00000233331 MMP14P50281 582 aa38.15■■■■□ 3.7
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INO80B-201ENST00000233331 CEP126Q9P2H0 1117 aa38.15■■■■□ 3.7
INO80B-201ENST00000233331 FAM205AQ6ZU69 1335 aa38.14■■■■□ 3.7
INO80B-201ENST00000233331 SLC5A1P13866 664 aa38.14■■■■□ 3.7
INO80B-201ENST00000233331 DLK2Q6UY11 383 aa38.14■■■■□ 3.7
INO80B-201ENST00000233331 SULF1Q8IWU6 871 aa38.14■■■■□ 3.7
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INO80B-201ENST00000233331 PANK1Q8TE04 598 aa38.1■■■■□ 3.69
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INO80B-201ENST00000233331 C1orf115Q9H7X2 142 aa38.09■■■■□ 3.69
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INO80B-201ENST00000233331 TLL2Q9Y6L7 1015 aa38.08■■■■□ 3.69
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INO80B-201ENST00000233331 DLGAP5Q15398 846 aa38.05■■■■□ 3.68
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INO80B-201ENST00000233331 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP38.04■■■■□ 3.68
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INO80B-201ENST00000233331 CFAP100Q494V2 611 aa38.02■■■■□ 3.68
INO80B-201ENST00000233331 SAPCD2Q86UD0 394 aa38.02■■■■□ 3.68
INO80B-201ENST00000233331 MTMR14Q8NCE2 650 aa38.01■■■■□ 3.68
INO80B-201ENST00000233331 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa38.01■■■■□ 3.68
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INO80B-201ENST00000233331 TFCP2Q12800 502 aa38■■■■□ 3.67
INO80B-201ENST00000233331 MYH13Q9UKX3 1938 aa38■■■■□ 3.67
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INO80B-201ENST00000233331 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP37.98■■■■□ 3.67
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INO80B-201ENST00000233331 CYP4F22Q6NT55 531 aa37.97■■■■□ 3.67
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INO80B-201ENST00000233331 SPDYE6P0CI01 402 aa37.96■■■■□ 3.67
INO80B-201ENST00000233331 GRIK5Q16478 980 aa37.96■■■■□ 3.67
INO80B-201ENST00000233331 C2orf69Q8N8R5 385 aa37.96■■■■□ 3.67
INO80B-201ENST00000233331 SSH3Q8TE77 659 aa37.96■■■■□ 3.67
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INO80B-201ENST00000233331 A0A1B0GUL7 405 aa37.94■■■■□ 3.66
INO80B-201ENST00000233331 MYO1BO43795 1136 aa37.94■■■■□ 3.66
INO80B-201ENST00000233331 PHKA1P46020 1223 aa37.94■■■■□ 3.66
INO80B-201ENST00000233331 HUNKP57058 714 aa37.94■■■■□ 3.66
INO80B-201ENST00000233331 TIMM10P62072 90 aa37.94■■■■□ 3.66
INO80B-201ENST00000233331 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
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INO80B-201ENST00000233331 COG6Q9Y2V7 657 aa37.94■■■■□ 3.66
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INO80B-201ENST00000233331 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
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INO80B-201ENST00000233331 HHIPL1Q96JK4 782 aa37.93■■■■□ 3.66
INO80B-201ENST00000233331 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
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INO80B-201ENST00000233331 CLRN2A0PK11 232 aa37.92■■■■□ 3.66
INO80B-201ENST00000233331 WDR66Q8TBY9 1149 aa37.92■■■■□ 3.66
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INO80B-201ENST00000233331 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
INO80B-201ENST00000233331 DDX19BQ9UMR2 479 aa37.91■■■■□ 3.66
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INO80B-201ENST00000233331 CCDC102BQ68D86 513 aa37.9■■■■□ 3.66
INO80B-201ENST00000233331 CEP85Q6P2H3 762 aa37.9■■■■□ 3.66
INO80B-201ENST00000233331 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
INO80B-201ENST00000233331 XAGE2Q96GT9 111 aa37.9■■■■□ 3.66
INO80B-201ENST00000233331 SURF6O75683 361 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
INO80B-201ENST00000233331 NEUROD6Q96NK8 337 aa37.89■■■■□ 3.66
INO80B-201ENST00000233331 VEZTQ9HBM0 779 aa37.89■■■■□ 3.66
INO80B-201ENST00000233331 SEMA3EO15041 775 aa37.88■■■■□ 3.65
INO80B-201ENST00000233331 DENND2AQ9ULE3 1009 aa37.88■■■■□ 3.65
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