RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Myh4Q5SX39 1939 aa26.63■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Oog3Q3UWY1 500 aa26.63■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa26.63■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mageb2A2AHM0 380 aa26.62■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc4a1P04919 929 aa26.62■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mxd3Q80US8 206 aa26.62■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trappc12Q8K2L8 797 aa26.62■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Riok1Q922Q2 567 aa26.62■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pou3f3P31361 497 aa26.61■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adamts19P59509 1210 aa26.61■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 EspnlQ3UYR4 1005 aa26.61■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abhd15Q5F2F2 459 aa26.61■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nell2Q61220 819 aa26.61■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ndfip2Q91ZP6 311 aa26.61■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abtb2Q7TQI7 1024 aa26.6■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bcar3Q9QZK2 820 aa26.6■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pde4aO89084 844 aa26.59■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam228bQ497Q6 232 aa26.59■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc44a4Q91VA1 707 aa26.59■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arfgef1G3X9K3 1846 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ankrd63A2ARS0 390 aa26.58■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Izumo3A6PWV3 263 aa26.58■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ifi207E9Q3L4 978 aa26.58■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fstl1Q62356 306 aa26.58■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nlrp9aQ66X03 949 aa26.58■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lman1lQ8VCD3 505 aa26.58■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krt25Q8VCW2 446 aa26.58■■□□□ 1.85
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Spg7Q3ULF4 781 aa26.57■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa26.57■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Erc2Q6PH08 957 aa26.57■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam160b2Q80YR2 744 aa26.57■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Taf5lQ91WQ5 589 aa26.57■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hdac9Q99N13 588 aa26.57■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Chmp5Q9D7S9 219 aa26.57■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 A0A1W2P7S8 802 aa26.56■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prl3d1P18121 224 aa26.56■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm5592Q3V0A6 857 aa26.56■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdc5lQ6A068 802 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 LdhdQ7TNG8 484 aa26.56■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kbtbd13Q8C828 458 aa26.56■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Foxn1Q61575 648 aa26.55■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zbtb45Q52KG4 520 aa26.54■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mast3Q3U214 1321 aa26.54■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wnt10bP48614 389 aa26.53■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sept9Q80UG5 583 aa26.53■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Polr3dQ91WD1 398 aa26.53■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dbr1Q923B1 550 aa26.53■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp34Q6ZQ93 3582 aa26.52■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 HunkO88866 714 aa26.52■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Irf6P97431 467 aa26.52■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tll1Q62381 1013 aa26.52■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trmt44Q9D2Q2 713 aa26.52■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam84aQ9D650 292 aa26.52■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Letm1Q9Z2I0 738 aa26.52■■□□□ 1.84
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TnksQ6PFX9 1320 aa26.51■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mmp14P53690 582 aa26.51■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc7a3P70423 618 aa26.51■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vps54Q5SPW0 977 aa26.51■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kif18aQ91WD7 886 aa26.51■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ube3bQ9ES34 1070 aa26.51■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prg3Q9JL95 222 aa26.51■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Myh13B1AR69 1938 aa26.51■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Myh3P13541 1940 aa26.51■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arrdc4A0A0B4J1F4 415 aa26.5■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa26.5■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zkscan2G3X952 960 aa26.5■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Map7O88735 730 aa26.5■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prl7d1P04769 244 aa26.5■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ttll12Q3UDE2 639 aa26.5■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc142Q8CAI1 738 aa26.5■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rhot2Q8JZN7 620 aa26.5■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rdm1Q9CQK3 281 aa26.5■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa26.49■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hmox1P14901 289 aa26.49■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Evi5P97366 809 aa26.49■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 OsbpQ3B7Z2 805 aa26.49■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nme8Q715T0 586 aa26.49■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wdr63B2RY71 923 aa26.48■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prpmp5E9PXN1 296 aa26.48■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 LtbrP50284 415 aa26.48■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam83bQ0VBM2 1012 aa26.48■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa26.48■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf697Q569E7 569 aa26.48■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Akap4Q60662 849 aa26.48■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pram1Q6BCL1 675 aa26.48■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cog5Q8C0L8 829 aa26.48■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem79Q9D709 391 aa26.48■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ZyxQ62523 564 aa26.47■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tgm5Q9D7I9 724 aa26.47■■□□□ 1.83
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc4a3P16283 1227 aa26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 63.7 ms