RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 SHEQ5VZ18 495 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 NEK7Q8TDX7 302 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 UPRTQ96BW1 309 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 MARVELD1Q9BSK0 173 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 FAIMQ9NVQ4 179 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 RFPL4AA6NLU0 287 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 A6NNC1 897 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 AMY2BP19961 511 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 MICBQ29980 383 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTBL2Q562R1 376 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZPA2 131 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 CREB3L1Q96BA8 519 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 CBLN4Q9NTU7 201 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 ETAA1Q9NY74 926 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 TREM2Q9NZC2 230 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 WIPI2Q9Y4P8 454 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 DYSFO75923 2080 aa20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 PSG2P11465 335 aa20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 PPOXP50336 477 aa20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 FLNCQ14315 2725 aa20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa20.89■□□□□ 0.94
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CAPNS1-215ENST00000628018 HPS1Q92902 700 aa20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJB11Q9UBS4 358 aa20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
CAPNS1-215ENST00000628018 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2AT4A6NND4 320 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 PMP2P02689 132 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 AMY2AP04746 511 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 IRF2P14316 349 aa20.88■□□□□ 0.93
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CAPNS1-215ENST00000628018 VAX1Q5SQQ9 334 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 AGAP6Q5VW22 663 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 C11orf71Q6IPW1 123 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 BTN2A1Q7KYR7 527 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CD177Q8N6Q3 437 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5T2Q8NGG2 359 aa20.88■□□□□ 0.93
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CAPNS1-215ENST00000628018 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
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CAPNS1-215ENST00000628018 GOSR1O95249 250 aa20.88■□□□□ 0.93
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CAPNS1-215ENST00000628018 FAM201AQ5SY85 155 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5AP2Q8NGF4 316 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM165Q9HC07 324 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 ANXA10Q9UJ72 324 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa20.87■□□□□ 0.93
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CAPNS1-215ENST00000628018 TFF1P04155 84 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 COL10A1Q03692 680 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZS49 121 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 DTX2Q86UW9 622 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 GAPTQ8N292 157 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5H2Q8NGV7 314 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 PPA2Q9H2U2 334 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 NUDT15Q9NV35 164 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 DCAF16Q9NXF7 216 aa20.87■□□□□ 0.93
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF222Q9UK12 451 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCA4P78363 2273 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFB6O95139 128 aa20.86■□□□□ 0.93
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CAPNS1-215ENST00000628018 SOD3P08294 240 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 CHRFAM7AQ494W8 412 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX36Q5VZQ5 186 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 ANGPTL6Q8NI99 470 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 SPOCK3Q9BQ16 436 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 Q9N2K0 584 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 METRNQ9UJH8 293 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 TANC2Q9HCD6 1990 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAV6A0A075B6T7 132 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-215ENST00000628018 POM121CA8CG34 1229 aa20.85■□□□□ 0.93
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