RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF170	Q96K19	258 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440		H3BS24	57 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440		M0R135	149 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CXCR6	O00574	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	NXPH2	O95156	264 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	NR2F1	P10589	423 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	HTR2A	P28223	471 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	PTGFR	P43088	359 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	GNG10	P50151	68 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CX3CL1	P78423	397 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	NATD1	Q8N6N6	113 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ABCB9	Q9NP78	766 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM206A	Q9NX38	181 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	HMGN4	O00479	90 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	PSCA	O43653	123 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	IDH3B	O43837	385 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	SMIM24	O75264	130 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	GNRHR	P30968	328 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	GPM6A	P51674	278 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	NCALD	P61601	193 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	DAD1	P61803	113 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	MYL5	Q02045	173 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CLC	Q05315	142 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	GRK1	Q15835	563 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	HSCB	Q8IWL3	235 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	FTMT	Q8N4E7	242 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35B4	Q969S0	331 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	SNX22	Q96L94	193 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440		A8MWP6	167 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	MFNG	O00587	321 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	NBR2	O15453	112 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	XRCC2	O43543	280 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	PROP1	O75360	226 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	BPNT1	O95861	308 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	FCER2	P06734	321 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CRABP2	P29373	138 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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