RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	BORCS8	Q96FH0	119 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	CHST6	Q9GZX3	395 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	LALBA	P00709	142 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	SERPINA3	P01011	423 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	IGLV1-47	P01700	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	CD33	P20138	364 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	GABRR1	P24046	479 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	VHL	P40337	213 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	OR3A1	P47881	315 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	NPBWR2	P48146	333 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	SYS1	Q8N2H4	156 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	DPM3	Q9P2X0	92 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1W2PRX2	142 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468		H3BSH0	61 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468		H3BUI4	141 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	BCL3	P20749	454 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	CD34	P28906	385 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	RBP2	P50120	134 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	IRF3	Q14653	427 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	KLHL22	Q53GT1	634 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	XAF1	Q6GPH4	301 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	UTS2B	Q765I0	119 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF596	Q8TC21	504 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	CORO2A	Q92828	525 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	ALG8	Q9BVK2	526 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	VCX	Q9H320	206 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	DUSP21	Q9H596	190 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	DAPL1	A0PJW8	107 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	SNTN	A6NMZ2	147 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468		K7EIL1	84 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	OR2F2	O95006	317 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	INMT	O95050	263 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	AMY1A	P04745	511 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	AMY2A	P04746	511 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	PF4V1	P10720	104 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	DCK	P27707	260 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	DUSP1	P28562	367 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	BRS3	P32247	399 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	ATP1B3	P54709	279 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	SLC35A2	P78381	396 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	RNLS	Q5VYX0	342 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	RDH10	Q8IZV5	341 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	MYDGF	Q969H8	173 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	SPSB1	Q96BD6	273 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	C4orf36	Q96KX1	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	HMG20A	Q9NP66	347 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	RAB26	Q9ULW5	256 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468	HHLA2	Q9UM44	414 aa		11.09	□□□□□ -0.63
MUC1-222	ENST00000610468		A0A087X0M5	115 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1B0GX30	115 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	LY6L	H3BQJ8	138 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	MPIG6B	O95866	241 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CYB5A	P00167	134 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	ISG15	P05161	165 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CSN2	P05814	226 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	HTR1A	P08908	422 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	PRKACA	P17612	351 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	PRKACB	P22694	351 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CDK2	P24941	298 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CD24	P25063	80 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	LMO1	P25800	156 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	ATP6V1E1	P36543	226 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	POU3F4	P49335	361 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CCR9	P51686	369 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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