RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM50BP56557 158 aa8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AESQ08117 197 aa8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EDDM3AQ14507 147 aa8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GRK1Q15835 563 aa8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ESCO2Q56NI9 601 aa8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPIN3Q5JUX0 258 aa8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF561Q8N587 486 aa8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KCNG3Q8TAE7 436 aa8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SNX22Q96L94 193 aa8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NAV3Q8IVL0 2385 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 B4DSR2 109 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FOXH1O75593 365 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MSMBP08118 114 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GLIPR1P48060 266 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GZMKP49863 264 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MADCAM1Q13477 382 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GPR176Q14439 515 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IL13RA2Q14627 380 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NHLRC3Q5JS37 347 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OLFML2AQ68BL7 652 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM200BQ69YZ2 307 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAB12Q6IQ22 244 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 USP43Q70EL4 1123 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR2W3Q7Z3T1 314 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C6orf201Q7Z4U5 140 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 COQ2Q96H96 371 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SULT4A1Q9BR01 284 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAAP24Q9BTP7 215 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TM2D1Q9BX74 207 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DNTTIP1Q9H147 329 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RHOFQ9HBH0 211 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GHRLQ9UBU3 117 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GLS2Q9UI32 602 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAB22AQ9UL26 194 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A8MXK9 166 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CD5LO43866 347 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HEXAP06865 529 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FUT3P21217 361 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CFPP27918 469 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BMXP51813 675 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EDDM3BP56851 147 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ARF6P62330 175 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF273Q14593 569 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CLEC9AQ6UXN8 241 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TCF23Q7RTU1 214 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IZUMO1Q8IYV9 350 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM185AQ8N0U4 392 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR8H2Q8N162 312 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM89BQ8N5H3 189 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCDC107Q8WV48 283 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM186Q96B77 213 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC25A38Q96DW6 304 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CST11Q9H112 138 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ATG5Q9H1Y0 275 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A075B6Q4 140 aa8.64□□□□□ -1.03
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.64□□□□□ -1.03
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.64□□□□□ -1.03
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MGST3O14880 152 aa8.64□□□□□ -1.03
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FOSL1P15407 271 aa8.64□□□□□ -1.03
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCL3L1P16619 93 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms