RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601247.5

FCHO1-235, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 458 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF788Q6ZQV5 615 aa12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 GDPD3Q7L5L3 318 aa12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 SDSLQ96GA7 329 aa12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 GAFA1Q96PS6 74 aa12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 FAAP24Q9BTP7 215 aa12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 PPA2Q9H2U2 334 aa12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 NARFLQ9H6Q4 476 aa12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 AUNIPQ9H7T9 357 aa12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF222Q9UK12 451 aa12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 CACNA1DQ01668 2161 aa12.77□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 TRAV24A0A0B4J272 114 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 CEACAM18A8MTB9 384 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 TFF1P04155 84 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 NDUFB7P17568 137 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 LMO1P25800 156 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 ETV6P41212 452 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 LSAMPQ13449 338 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 BRICD5Q6PL45 260 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 BIVMQ86UB2 503 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 BPIFB2Q8N4F0 458 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 FAM216BQ8N7L0 139 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 C10orf105Q8TEF2 133 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 BPESC1Q9GZL8 116 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 CHST6Q9GZX3 395 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 FAM234AQ9H0X4 552 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 ING3Q9NXR8 418 aa12.76□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 A0A0G2JMP0 313 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 A0A0X1KG70 313 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM235A6NFC5 223 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 MFNGO00587 321 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 MGST3O14880 152 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 CA11O75493 328 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 TK1P04183 234 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 SLC25A16P16260 332 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 CBX5P45973 191 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 INPP1P49441 399 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM50BP56557 158 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 EDDM3BP56851 147 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 EDDM3AQ14507 147 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF260Q3ZCT1 412 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 PLAC9Q5JTB6 97 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 HACD4Q5VWC8 232 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 SIGIRRQ6IA17 410 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 OR8H2Q8N162 312 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 ZNRF1Q8ND25 227 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 OR4M2Q8NGB6 313 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 SETD6Q8TBK2 473 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 FCAMRQ8WWV6 532 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 RAB39BQ96DA2 213 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 SULT4A1Q9BR01 284 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 SCPEP1Q9HB40 452 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 C12orf4Q9NQ89 552 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 IFT46Q9NQC8 304 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 KAAG1Q9UBP8 84 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 AK3Q9UIJ7 227 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 METRNQ9UJH8 293 aa12.75□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 K7N7A8 449 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 OR3A1P47881 315 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 ESCO2Q56NI9 601 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 KRBOX4Q5JUW0 171 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 Q5PR19 223 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 SHEQ5VZ18 495 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 LYPD2Q6UXB3 125 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 OR4S1Q8NGB4 309 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 ST8SIA4Q92187 359 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 AKIP1Q9NQ31 210 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF581Q9P0T4 197 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 CLN8Q9UBY8 286 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 MAB21L2Q9Y586 359 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 V9GYH0 126 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 LRBAP50851 2863 aa12.74□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM82A0PJX8 343 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 SULT1C2O00338 296 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 DVL1O14640 695 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 PSPNO60542 156 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 HLA-DQB1P01920 261 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 CSN2P05814 226 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 LPLP06858 475 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 NPY4RP50391 375 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 GNB2P62879 340 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 C17orf107Q6ZR85 190 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 GDPD1Q8N9F7 314 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa12.73□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 MEIKINA0A087WXM9 373 aa12.72□□□□□ -0.37
FCHO1-235ENST00000601247 GABARAPH6UMI1 98 aa12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms