RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596365.5

LINC00649-208, long intergenic non-protein coding RNA 649, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00649, Length 682 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00649-208ENST00000596365 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 FUOMA2VDF0 154 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 NUPR2A6NF83 97 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 FAM183AA6NL82 134 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 LINC01619G3V211 115 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 MPZL2O60487 215 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 DEDDO75618 318 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 ATP6V1G2O95670 118 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 HAND1O96004 215 aa6.51□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 P2RX3P56373 397 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 CGB2Q6NT52 195 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.51□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 COMMD2Q86X83 199 aa6.51□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 RNF148Q8N7C7 305 aa6.51□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 OR9G1Q8NH87 305 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 CEP19Q96LK0 163 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 KCTD7Q96MP8 289 aa6.51□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 ZNF580Q9UK33 172 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 STUB1Q9UNE7 303 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 CXorf65A6NEN9 183 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 ACOD1A6NK06 481 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 NOTOA8MTQ0 251 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 CXCR6O00574 342 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 GSTA4O15217 222 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 IGLV1-51P01701 117 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 IGF1P05019 195 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 CLUP10909 449 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 IFNGR2P38484 337 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 PTGFRP43088 359 aa6.5□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 SMIM11AP58511 58 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 TSPAN31Q12999 210 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 RIPK1Q13546 671 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 CRMP1Q14194 572 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 COQ5Q5HYK3 327 aa6.5□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.5□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.5□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 KLK15Q9H2R5 256 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 GID8Q9NWU2 228 aa6.5□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 F8VVB4 439 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 F8VWA3 439 aa6.49□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 MRASO14807 208 aa6.49□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 BRI3O95415 125 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 LYNP07948 512 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 NFYBP25208 207 aa6.49□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 OR3A1P47881 315 aa6.49□□□□□ -1.37
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LINC00649-208ENST00000596365 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 Q8N6K4 173 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 LRGUKQ96M69 825 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 GPR84Q9NQS5 396 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 GPR173Q9NS66 373 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 KRT84Q9NSB2 600 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-208ENST00000596365 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.49□□□□□ -1.37
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