RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SHOXO15266 292 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 IGKV1D-12P01611 117 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS2P15880 293 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 RBM11P57052 281 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 TAF9Q16594 264 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 NKAPLQ5M9Q1 402 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 FCGR3AP08637 254 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 FUT3P21217 361 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 BMP5P22003 454 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINF1P36955 418 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 CEACAM21Q3KPI0 293 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 KCTD9Q7L273 389 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 OR51F2Q8NH61 342 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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CAPNS1-204ENST00000587718 C5orf51A6NDU8 294 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV3-9P01782 118 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 NMBP08949 121 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 UCP3P55916 312 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB1AP62820 205 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
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CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00596Q86U02 117 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXL14Q8N1E6 418 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10AD1Q8NGE0 317 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5A2Q8NGI9 324 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5L1Q8NGL2 311 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 OR1K1Q8NGR3 316 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 PIK3IP1Q96FE7 263 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 RHOFQ9HBH0 211 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF286AQ9HBT8 521 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 ST3GAL6Q9Y274 331 aa21.74■■□□□ 1.07
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CAPNS1-204ENST00000587718 HIVEP1P15822 2718 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM221AA4D161 298 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A20A6NK97 555 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 CCSO14618 274 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 HLA-HP01893 362 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 PET100P0DJ07 73 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 ASCL1P50553 236 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 DMRTC1Q5HYR2 192 aa21.74■■□□□ 1.07
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CAPNS1-204ENST00000587718 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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CAPNS1-204ENST00000587718 FAAP24Q9BTP7 215 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf123Q9NWV4 160 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 MPC1Q9Y5U8 109 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 C5orf49A4QMS7 147 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF222A6NCQ9 220 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF850A8MQ14 1090 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5H8P0DN80 308 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 PGAM2P15259 253 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 APLNRP35414 380 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 PRDX4Q13162 271 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 AANATQ16613 207 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 MPV17LQ2QL34 196 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF611Q8N823 705 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 ST8SIA2Q92186 375 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 SEC22AQ96IW7 307 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf50Q96LR7 162 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 SULT4A1Q9BR01 284 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 PLK3Q9H4B4 646 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 C12orf4Q9NQ89 552 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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CAPNS1-204ENST00000587718 SGPP2Q8IWX5 399 aa21.72■■□□□ 1.07
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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CAPNS1-204ENST00000587718 A0A096LPE4 126 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PPZ6 126 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5B21A6NL26 309 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 POM121CA8CG34 1229 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM25EA8MYX2 175 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 IFNA2P01563 188 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 FGF12P61328 243 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-204ENST00000587718 PDZD9Q8IXQ8 264 aa21.71■■□□□ 1.07
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