RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584944.5

TRAF4-215, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF4, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-215ENST00000584944 PHF21AQ96BD5 680 aa11.5□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FAM3DQ96BQ1 224 aa11.5□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 NEDD4LQ96PU5 975 aa11.5□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 BARHL1Q9BZE3 327 aa11.5□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 PPA2Q9H2U2 334 aa11.5□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 DUX4Q9UBX2 424 aa11.5□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.5□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 MAB21L2Q9Y586 359 aa11.5□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 AUP1Q9Y679 476 aa11.5□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 CCDC160A6NGH7 325 aa11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 MCRIP1C9JLW8 97 aa11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 AIPO00170 330 aa11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 MGST3O14880 152 aa11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 CLDN12P56749 244 aa11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 PDCD1Q15116 288 aa11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 TAF9Q16594 264 aa11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 CR1LQ2VPA4 569 aa11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 IDNKQ5T6J7 187 aa11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 CRIP3Q6Q6R5 217 aa11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 OR2W3Q7Z3T1 314 aa11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 OR4M1Q8NGD0 313 aa11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 OR51D1Q8NGF3 324 aa11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 LIN7BQ9HAP6 207 aa11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 METRNQ9UJH8 293 aa11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa11.49□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 A0A0G2JK05 382 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 hADV38S2A0JD32 116 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 METTL21EPA6NDL7 271 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 VSIG8P0DPA2 414 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 SERPINB10P48595 397 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 NHLRC3Q5JS37 347 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 KRBOX4Q5JUW0 171 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 NKAPLQ5M9Q1 402 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FAM120AOSQ5T036 256 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM104Q8NE00 496 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 Q8NFD4 153 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 PCGF1Q9BSM1 259 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 DCTN5Q9BTE1 182 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 RNF167Q9H6Y7 350 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 MMP26Q9NRE1 261 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 INSIG2Q9Y5U4 225 aa11.48□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 A0A1W2PP11 408 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FAM90A10PA6NDY2 464 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FAM90A18PA6NE21 464 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FAM90A16PA6NEW6 464 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FAM90A7PA6NKC0 464 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 RNF212BA8MTL3 300 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FAM90A22PA8MWA6 464 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FAM90A12PA8MX19 464 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 C22orf46C9J442 243 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF737O75373 536 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 TOX4O94842 621 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 IFNA2P01563 188 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FAM90A15PP0C7V4 464 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FAM90A13PP0C7W8 464 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FAM90A14PP0C7W9 464 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FAM90A24PP0C7X0 464 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 AMY2BP19961 511 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FUT3P21217 361 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 KCNJ3P48549 501 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 VBP1P61758 197 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 ARF6P62330 175 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 C2orf76Q3KRA6 126 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 CHRFAM7AQ494W8 412 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 OR10K2Q6IF99 312 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 RAB12Q6IQ22 244 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 SFXN4Q6P4A7 337 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 USP43Q70EL4 1123 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 SUMF2Q8NBJ7 301 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 OR4S1Q8NGB4 309 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 NANPQ8TBE9 248 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 RAB22AQ9UL26 194 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 PEX16Q9Y5Y5 336 aa11.47□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 MEIKINA0A087WXM9 373 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM82A0PJX8 343 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 PSPNO60542 156 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 IL1AP01583 271 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 TFAP2AP05549 437 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 LMO1P25800 156 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 OR3A1P47881 315 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 ALDH3B2P48448 385 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 P2RX3P56373 397 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms