RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572156.1

AKAP1-207, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene AKAP1, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-207ENST00000572156 SHARPINQ9H0F6 387 aa13.13□□□□□ -0.31
AKAP1-207ENST00000572156 ZNF581Q9P0T4 197 aa13.13□□□□□ -0.31
AKAP1-207ENST00000572156 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
AKAP1-207ENST00000572156 ZANQ9Y493 2812 aa13.13□□□□□ -0.31
AKAP1-207ENST00000572156 TLN2Q9Y4G6 2542 aa13.12□□□□□ -0.31
AKAP1-207ENST00000572156 TRAV24A0A0B4J272 114 aa13.12□□□□□ -0.31
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AKAP1-207ENST00000572156 C19orf12Q9NSK7 152 aa13.11□□□□□ -0.31
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AKAP1-207ENST00000572156 FAM90A22PA8MWA6 464 aa13.09□□□□□ -0.31
AKAP1-207ENST00000572156 FAM90A12PA8MX19 464 aa13.09□□□□□ -0.31
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AKAP1-207ENST00000572156 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa13.09□□□□□ -0.31
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AKAP1-207ENST00000572156 LY6G5BQ8NDX9 201 aa13.09□□□□□ -0.31
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AKAP1-207ENST00000572156 HIVEP2P31629 2446 aa13.08□□□□□ -0.32
AKAP1-207ENST00000572156 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
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