RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567377.5

COMMD4-218, Transcript of COMM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene COMMD4, Length 461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4-218ENST00000567377 OR4C13Q8NGP0 309 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 CLEC7AQ9BXN2 247 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 TMEM133Q9H2Q1 129 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.72□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 CALCBP10092 127 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 GABRA5P31644 462 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 SOX2P48431 317 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 KCNJ3P48549 501 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 ST3GAL4Q11206 333 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 IL13RA2Q14627 380 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 SLC35E4Q6ICL7 350 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 ASCL4Q6XD76 172 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 SATL1Q86VE3 508 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 TPRX1Q8N7U7 411 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 OR51T1Q8NGJ9 327 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 OR6C3Q9NZP0 311 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 CKLFQ9UBR5 152 aa14.71□□□□□ -0.05
COMMD4-218ENST00000567377 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa14.7□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 SCN1BQ07699 218 aa14.7□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 RSU1Q15404 277 aa14.7□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.7□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.7□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.7□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.7□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 GGHQ92820 318 aa14.7□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 GHSRQ92847 366 aa14.7□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.7□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 TCF7L1Q9HCS4 588 aa14.7□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 VWFP04275 2813 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 ODAMA1E959 279 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 GABRPO00591 440 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 GPX5O75715 221 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 PTGFRP43088 359 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 ARHGDIBP52566 201 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 PAX5Q02548 391 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 AESQ08117 197 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 FAM189A2Q15884 450 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 SSX2Q16385 188 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 LY6EQ16553 131 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 KRBOX4Q5JUW0 171 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 XAF1Q6GPH4 301 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 RNF144BQ7Z419 303 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 OR4D6Q8NGJ1 314 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF596Q8TC21 504 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 PIFOQ8TCI5 191 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 THRSPQ92748 146 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 S100A13Q99584 98 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 METTL9Q9H1A3 318 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 TAS2R4Q9NYW5 299 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 IL36GQ9NZH8 169 aa14.69□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 H0YJX3 145 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 CD1AP06126 327 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 HTR1DP28221 377 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 BDKRB2P30411 391 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 GLIPR1P48060 266 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 Q499Y3 187 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 LINC00596Q86U02 117 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 ABHD12Q8N2K0 398 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 STX19Q8N4C7 294 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF485Q8NCK3 441 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 NDNFQ8TB73 568 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 FBLIM1Q8WUP2 373 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 TCF19Q9Y242 345 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 NOTCH1P46531 2555 aa14.68□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 CDK2P24941 298 aa14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 CD34P28906 385 aa14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 CEACAM3P40198 252 aa14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 PRRX1P54821 245 aa14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 BDH1Q02338 343 aa14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 RIPK1Q13546 671 aa14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 GPR176Q14439 515 aa14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 DDI2Q5TDH0 399 aa14.67□□□□□ -0.06
COMMD4-218ENST00000567377 CDH26Q8IXH8 852 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms