RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARL6IP5O75915 188 aa18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GTF2F2P13984 249 aa18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCL3L1P16619 93 aa18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RBM11P57052 281 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PIGYQ3MUY2 71 aa18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCTD21Q4G0X4 260 aa18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC22A6Q4U2R8 563 aa18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBE2UQ5VVX9 321 aa18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AWAT2Q6E213 333 aa18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF773Q6PK81 442 aa18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM91Q6ZNR0 172 aa18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LINC00596Q86U02 117 aa18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRTM1Q86UE6 522 aa18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ST3GAL6Q9Y274 331 aa18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LINC00312Q9Y6C7 94 aa18.18■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNF212BA8MTL3 300 aa18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RBP4P02753 201 aa18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF728P0DKX0 622 aa18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SRMP19623 302 aa18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SSX1Q16384 188 aa18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GLT8D1Q68CQ7 371 aa18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TCF23Q7RTU1 214 aa18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR4D6Q8NGJ1 314 aa18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZFAND2BQ8WV99 257 aa18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF714Q96N38 554 aa18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NDUFB11Q9NX14 153 aa18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DSCAML1Q8TD84 2053 aa18.17■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C17orf98A8MV24 154 aa18.16■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM77I1YAP6 450 aa18.16■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DLX6P56179 175 aa18.16■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERVFRD-1P60508 538 aa18.16■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FABP5Q01469 135 aa18.16■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLRD1Q13241 179 aa18.16■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MPV17LQ2QL34 196 aa18.16■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDZD9Q8IXQ8 264 aa18.16■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C11orf42Q8N5U0 333 aa18.16■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TPRX1Q8N7U7 411 aa18.16■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MDFIQ99750 246 aa18.16■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRDM13Q9H4Q3 707 aa18.16■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IFT22Q9H7X7 185 aa18.16■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GHRLQ9UBU3 117 aa18.16■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRAV24A0A0B4J272 114 aa18.15■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCNJ3P48549 501 aa18.15■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBE2E1P51965 193 aa18.15■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DLX1P56177 255 aa18.15■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DEFB112Q30KQ8 113 aa18.15■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZDHHC22Q8N966 263 aa18.15■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa18.15■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ESM1Q9NQ30 184 aa18.15■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A1W2PP11 408 aa18.14■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCRL2O00421 344 aa18.14■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NPFFO15130 113 aa18.14■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBBP0CG47 229 aa18.14■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSMB9P28065 219 aa18.14■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AESQ08117 197 aa18.14■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KRBOX4Q5JUW0 171 aa18.14■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C1orf100Q5SVJ3 147 aa18.14■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa18.14■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PIP4P2Q8N4L2 257 aa18.14■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COQ2Q96H96 371 aa18.14■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATRQ13535 2644 aa18.14■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa18.13■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa18.13■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ODAMA1E959 279 aa18.13■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa18.13■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HSPB6O14558 160 aa18.13■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GALP22466 123 aa18.13■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBA52P62987 128 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PAX5Q02548 391 aa18.13■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BAMBIQ13145 260 aa18.13■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HCP5Q6MZN7 132 aa18.13■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa18.13■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZDHHC16Q969W1 377 aa18.13■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CST11Q9H112 138 aa18.13■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLDN34H7C241 214 aa18.12■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CD37P11049 281 aa18.12■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MGMTP16455 207 aa18.12■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CALRP27797 417 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GLIPR1P48060 266 aa18.12■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CORO2AQ92828 525 aa18.12■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C19orf24Q9BVV8 132 aa18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms