RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABHD1Q96SE0 405 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 OPA3Q9H6K4 179 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF222Q9UK12 451 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ODF3BA8MYP8 253 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 E9PI62 339 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANGPT2O15123 496 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 SYNGR1O43759 233 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 NDUFB2O95178 105 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 MZT1Q08AG7 82 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR6V1Q8N148 313 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 LGALS12Q96DT0 336 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 PITX2Q99697 317 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 RERGLQ9H628 205 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 B9D1Q9UPM9 204 aa6.62□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 GGT3PA6NGU5 568 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 H0YHG0 523 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 CRABP1P29762 137 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 OMPP47874 163 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 DYNLT3P51808 116 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPIBQ01892 262 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLHL12Q53G59 568 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 TBPL2Q6SJ96 375 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 DRAM2Q6UX65 266 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 MKXQ8IYA7 352 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 MS4A10Q96PG2 267 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR5M11Q96RB7 305 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 LITAFQ99732 161 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.61□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDIPTO14735 213 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 IFNW1P05000 195 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALDOBP05062 364 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 DDOSTP39656 456 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 GSK3BP49841 420 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 BLCAPP62952 87 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 SELENOWP63302 87 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 CX3CL1P78423 397 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM3AP98173 230 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 MUC7Q8TAX7 377 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYDGFQ969H8 173 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPTSSAQ969W0 71 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 TLCD1Q96CP7 247 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.6□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.59□□□□□ -1.35
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms