RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553846.1

PRKCH-208, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 4

Gene PRKCH, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-208	ENST00000553846	COMMD2	Q86X83	199 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	MNT	Q99583	582 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	SPATA25	Q9BR10	227 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	TOR1A	O14656	332 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	OVOL1	O14753	267 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	ARPC2	O15144	300 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	ZNF254	O75437	659 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	OR2H2	O95918	312 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	IGLV1-40	P01703	118 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	HSD17B1	P14061	328 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	BCL3	P20749	454 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	KIR3DL2	P43630	455 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	RAB7A	P51149	207 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	PRRX1	P54821	245 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	AES	Q08117	197 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846		Q6P435	159 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846		Q8IYB0	196 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	LEAP2	Q969E1	77 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	KCTD7	Q96MP8	289 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	GON7	Q9BXV9	100 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	CHST5	Q9GZS9	411 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	HMG20A	Q9NP66	347 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	PSG11	Q9UQ72	335 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	SIRPB1	O00241	398 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	TNFRSF11B	O00300	401 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	SAP30	O75446	220 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	CCNB2	O95067	398 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	IGKV1D-12	P01611	117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	MADCAM1	Q13477	382 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	HES1	Q14469	280 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	MICA	Q29983	383 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	CPO	Q8IVL8	374 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	NABP2	Q9BQ15	211 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	MRO	Q9BYG7	248 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846		R4GMQ9	66 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKCH-208	ENST00000553846	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-208	ENST00000553846	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-208	ENST00000553846	HSD17B6	O14756	317 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-208	ENST00000553846	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-208	ENST00000553846	INMT	O95050	263 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-208	ENST00000553846	IL1A	P01583	271 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-208	ENST00000553846	IGLV1-51	P01701	117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-208	ENST00000553846	IGHV3-7	P01780	117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-208	ENST00000553846	CALCB	P10092	127 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-208	ENST00000553846	CNTFR	P26992	372 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-208	ENST00000553846	POU3F4	P49335	361 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-208	ENST00000553846	FUT6	P51993	359 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-208	ENST00000553846	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-208	ENST00000553846	SLURP1	P55000	103 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-208	ENST00000553846	PAX5	Q02548	391 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-208	ENST00000553846	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	6.96	□□□□□ -1.3
PRKCH-208	ENST00000553846	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		6.96	□□□□□ -1.3

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