RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FABP12A6NFH5 140 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 A6NJ64 397 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CLDN25C9JDP6 229 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SOCS1O15524 211 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 XRCC3O43542 346 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.73□□□□□ -1.33
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BEST3-211ENST00000552295 SSTR2P30874 369 aa6.73□□□□□ -1.33
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BEST3-211ENST00000552295 MNDAP41218 407 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 PITPNBP48739 271 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 PTH2RP49190 550 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 VEGFCP49767 419 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TAS2R20P59543 309 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 GMFBP60983 142 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ZNF45Q02386 682 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 MADCAM1Q13477 382 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 IL13RA2Q14627 380 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM189A2Q15884 450 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ZNF79Q15937 498 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TAF9Q16594 264 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM201AQ5SY85 155 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RAB12Q6IQ22 244 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 OR4M2Q8NGB6 313 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 S100ZQ8WXG8 99 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 YIPF5Q969M3 257 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SEH1LQ96EE3 360 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CYYR1Q96J86 154 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 DIABLOQ9NR28 239 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RASL12Q9NYN1 266 aa6.73□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 LRRC30A6NM36 301 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TMEM178BH3BS89 294 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 IFNL4K9M1U5 179 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 MFNGO00587 321 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 NDUFS7O75251 213 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RP2O75695 350 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SCGNO76038 276 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 LY6HO94772 140 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TPPPO94811 219 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 HLA-DQB1P01920 261 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CHRM2P08172 466 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 IRF2P14316 349 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 COL8A2P25067 703 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CHATP28329 748 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 DUSP1P28562 367 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CD80P33681 288 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 NR4A2P43354 598 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TMEM50BP56557 158 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 COL10A1Q03692 680 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ZNF146Q15072 292 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 PDCD1Q15116 288 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 MPV17LQ2QL34 196 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 Q6P435 159 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 LINC00596Q86U02 117 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CCL17Q92583 94 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 NRGNQ92686 78 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 PHF21AQ96BD5 680 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 ABHD1Q96SE0 405 aa6.72□□□□□ -1.33
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