RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 OLFML2AQ68BL7 652 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAT1Q6PIZ9 186 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 BRICD5Q6PL45 260 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 HEPN1Q6WQI6 88 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 C16orf82Q7Z2V1 217 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 OSR2Q8N2R0 312 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 PNKDQ8N490 385 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 JAGN1Q8N5M9 183 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 OR10A7Q8NGE5 316 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2T6Q8NHC8 308 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 NEK7Q8TDX7 302 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 TFAP2CQ92754 450 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 GGHQ92820 318 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 GHSRQ92847 366 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 UFD1Q92890 307 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 SEH1LQ96EE3 360 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF488Q96MN9 340 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 DUX5Q96PT3 197 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 SSX3Q99909 188 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 UQCC2Q9BRT2 126 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 CENPOQ9BU64 300 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF696Q9H7X3 374 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 ESM1Q9NQ30 184 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 TNFRSF19Q9NS68 423 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 C19orf12Q9NSK7 152 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 IL36GQ9NZH8 169 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa4.59□□□□□ -1.67
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CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC42Q9Y546 428 aa4.59□□□□□ -1.67
CLSTN3-215ENST00000544584 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 MEIKINA0A087WXM9 373 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1B0GW55 424 aa4.58□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM90A7PA6NKC0 464 aa4.58□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 FAM90A22PA8MWA6 464 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM90A12PA8MX19 464 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa4.58□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF737O75373 536 aa4.58□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 ARL6IP5O75915 188 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 HTR3BO95264 441 aa4.58□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 FAM90A13PP0C7W8 464 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM90A14PP0C7W9 464 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM90A24PP0C7X0 464 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM106CPP0CH98 169 aa4.58□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 DUX4L6P0CJ89 424 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 DUX4L7P0CJ90 424 aa4.58□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
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CLSTN3-215ENST00000544584 C6orf183Q5T699 404 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 AWAT2Q6E213 333 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 Q6ZTK2 550 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 AHSA2Q719I0 299 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 ABHD12Q8N2K0 398 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 Q8N7P7 452 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR11H6Q8NGC7 330 aa4.58□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR51A4Q8NGJ6 313 aa4.58□□□□□ -1.68
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