RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	GDNF	P39905	211 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	GLIPR1	P48060	266 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	ARHGDIB	P52566	201 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	AES	Q08117	197 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	AASS	Q9UDR5	926 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777		H0YHG0	523 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	TOR1A	O14656	332 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	KDM4B	O94953	1096 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	OR2F2	O95006	317 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	MPIG6B	O95866	241 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	PF4	P02776	101 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	ISG15	P05161	165 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF44	P15621	663 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	LMO1	P25800	156 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	SCN1B	Q07699	218 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	FDX2	Q6P4F2	183 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	RNF144B	Q7Z419	303 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	MYDGF	Q969H8	173 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	SPACA5	Q96QH8	159 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	HHLA2	Q9UM44	414 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	DAPL1	A0PJW8	107 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	ODAM	A1E959	279 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	ATP6V1G2	O95670	118 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	HTR1A	P08908	422 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	CD34	P28906	385 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	CEACAM3	P40198	252 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	PTGFR	P43088	359 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	PRRX1	P54821	245 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	RNFT2	Q96EX2	444 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	RHOF	Q9HBH0	211 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	NEK6	Q9HC98	313 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	ING3	Q9NXR8	418 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	SLC16A6	O15403	523 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	MT-ND2	P03891	347 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	AMY1A	P04745	511 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	AMY2A	P04746	511 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	CCR9	P51686	369 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	SLC35A2	P78381	396 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777		Q6P435	159 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	COQ2	Q96H96	371 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	LY6L	H3BQJ8	138 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777		J3QLW9	94 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777		J3QRE1	110 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	DEGS1	O15121	323 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	CSN2	P05814	226 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF19	P17023	458 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	MNDA	P41218	407 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	OR3A4P	P47883	348 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	CHST4	Q8NCG5	386 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
DDX11-222	ENST00000542777		A0A087X0M5	115 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1B0GX30	115 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	OOSP1	A8MZH6	123 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777		K7EIL1	84 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777		M0QZK8	103 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	CLIC3	O95833	236 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	NFYB	P25208	207 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	RIPK1	Q13546	671 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	UTF1	Q5T230	341 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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