RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 MPGP29372 298 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 BTCP35070 178 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 Q0VFX4 171 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 IL24Q13007 206 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 STPG1Q5TH74 334 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 BATF2Q8N1L9 274 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 FADS6Q8N9I5 356 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 IP6K3Q96PC2 410 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ATP6V0BQ99437 205 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 FOXB1Q99853 325 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 SLC6A7Q99884 636 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CST11Q9H112 138 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CADP27708 2225 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PNV4 684 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ZNHIT1O43257 154 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 XRCC3O43542 346 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CD3DP04234 171 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CD1AP06126 327 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CSF1P09603 554 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 AKAIN1P0CW23 69 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 RPA2P15927 270 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 MTCP1P56278 107 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 SULF2Q8IWU5 870 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR2M7Q8NG81 312 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PIGCQ92535 297 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM56Q96MV1 263 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 IGHMP01871 453 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 LIPFP07098 398 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CRYGCP07315 174 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CELA3AP09093 270 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF32P17041 273 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 MEOX1P50221 254 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 HERPUD1Q15011 391 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 DOK3Q7L591 496 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 BORCS8Q96FH0 119 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 SPXQ9BT56 116 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 DEPPQ9NTK1 212 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 HPXP02790 462 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ITGB2P05107 769 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 FABP4P15090 132 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 BRS3P32247 399 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CAMLGP49069 296 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1B0GV72 72 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PPH5 198 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF724A8MTY0 619 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CCL25O15444 150 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 NKX2-8O15522 239 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 RAB6AP20340 208 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 GZMHP20718 246 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PCBD1P61457 104 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 HMGN3Q15651 99 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.85□□□□□ -1.31
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